かつて、幾度となく地球の危機を救った戦士･孫悟空は、妻のチチや息子の悟飯とともに平和に暮らしていた。そんなある日、悟空は悟飯を連れて師匠の亀仙人のもとを訪れる。
悟空の前に突如現れた男は、自らを兄・ラディッツだと名乗った！ 任務のために、仲間になるよう強要するが、悟空は拒否！ 怒りのラディッツに悟飯を連れ去られてしまう！
悟飯救出のため、悟空はライバルのピッコロと共闘し、ラディッツに攻撃を仕掛けるが、圧倒的な攻撃を前にまったく太刀打ちができない！ 万事休すかと思われたそのとき…。
ラディッツ戦で天国へ行った悟空は、界王さまのもとで修行を積むため、閻魔大王のもとから蛇の道を走り出す！ 一方、ピッコロはサイヤ人襲来に備え、悟飯を育てる特訓を開始する。
ピッコロが悟飯に課した最初の修行は、6カ月間を生き延びること。荒野での厳しい生活に弱音を吐く悟飯だったが、夜中に満月を目撃して、凶暴な大猿へと変身してしまう！
蛇の道を走り抜けて界王星にたどり着いた悟空は、界王様をギャグで笑わせるテストに合格！ まずは重力が地球の10倍もある界王の星の環境を克服する修行をスタートする。
悟飯たちが修行に励んでいる頃、悟空はついにバブルス君を捕まえる課題に成功！ 2つ目の課題も見事クリアして、いよいよ界王様から直接修行をつけてもらうことになった。
孫悟空がついに復活！ 界王の星で修行を終え、元気玉をも完成させた悟空はドラゴンボールで生き返り、下界へ急ぐ。だが悟空よりも先にサイヤ人たちのポッドが地球に迫る！
地球に降り立ったサイヤ人は、高い戦闘力を求めてピッコロのもとへ。そこへクリリンたちも現れ、栽培マンを相手に戦闘開始！ 奮闘するヤムチャに栽培マンの意外な反撃が…。
クリリンたちは修行の成果を発揮し、見事に栽培マンを全滅させた。しかし、次の敵ナッパには餃子の捨て身の攻撃も通用しない。怒った天津飯は、命がけで気功砲を放つ！
ベジータは悟空の存在が気になり、戦闘を３時間ほど中断。しかし戦闘再開の時が来ても悟空は現れない…。ピッコロたちは何とか持ちこたえようと、巧みな作戦で戦い続ける。
予想外の苦戦に激怒したナッパが、悟飯に襲いかかる…！ ピッコロは悟飯をかばうが力及ばず、悟飯もトドメをさされようかというその時、筋斗雲に乗った悟空がやって来た！
界王拳でナッパを仕留めた悟空は、場所を移してベジータとの一騎打ちに挑む！ しかし、2倍界王拳でもベジータにはかなわず、界王拳を３倍へと引き上げることを決意する。
悟空は体の限界を超え界王拳を3倍から4倍へと強化し、ベジータのギャリック砲をかめはめ波で押し返した。だが、プライドを砕かれたベジータは大猿へと変身してしまう！
ベジータの猛攻を受け、悟空は大ピンチ。そのとき大猿の尻尾を切り、ベジータの変身を解いたのはヤジロベーだった。悟空は最後の力を振り絞り、元気玉をクリリンに託す。
運命をかけた元気玉が直撃し勝利を喜ぶ悟空たち！ だが、その喜びも束の間、ベジータはボロボロになりながらも命をとりとめていた。絶体絶命と思われたその時、悟飯が…！
悟空たちは死闘の末、ベジータを撃退した。だが、ピッコロの死でドラゴンボールが消滅。二度と仲間を復活させられない。そんな中クリリンは、ある可能性を語り始める…。
ドラゴンボールのあるナメック星に行くため、ユンザビット高地に宇宙船を探しに来たブルマとミスター・ポポ。そこで2人は、地球の神を運んできた宇宙船を発見する。
1カ月の旅を終え、ブルマたちは無事ナメック星に到着する。しかし、そこには宿敵･ベジータ、さらには宇宙を力で支配する組織の親玉・フリーザまでもやって来ていた！
フリーザは、ナメック星の村々から強引にドラゴンボールを奪い、願いを叶えようとしていた。一方ベジータは、フリーザの部下･キュイを粉砕。ボール集めに取りかかる！
フリーザ一味は、ドラゴンボールを渡さないナメック星人をいたぶり、倒し、圧倒的な戦力差を見せつける。様子を見ていた悟飯とクリリンだが、一味の強さに手を出せず…。
ドラゴンボールを脅し取ったフリーザは、残った村人たちまで襲いはじめる！ それを見ていた悟飯は、彼らの非道なやり口に逆上！ 逃げ惑う子供を救うために飛び出すが…。
クリリンは、救出した子供・デンデの案内で、星を治める最長老のもとへ向かう。一方ベジータは、ナメック星人の村を強襲！ 1つ目のドラゴンボールを手に入れてしまう。
サイヤ人との闘いで敗れたピッコロたちが、界王の星に到着。界王のもとで修行を開始する！ 一方ナメック星では、ドラゴンボール探しをしていたザーボンにベジータが襲いかかる！
最長老の家に到着したクリリンは、最後のドラゴンボールを託される。一方、フリーザはベジータに隠されたドラゴンボールのありかを吐かせようと画策。ベジータの探索に乗り出す。
フリーザの宇宙船で治療を受けたベジータは、不意をついて、フリーザの持つドラゴンボールをすべて奪って逃走する！ フリーザは激怒し、ザーボンを向かわせるのだが…。
ザーボンを倒したベジータは、ボールをすべて手に入れたと歓喜する。しかし、悟飯がベジータの隠したボールを発見。持ち帰ろうとしていたところ、ベジータと遭遇して…。
最長老のもとへと向かう悟飯とクリリンは、急ぐあまりベジータに居場所を発見されてしまう。一方、宇宙からはフリーザ直属のエリート部隊・ギニュー特戦隊が接近し…。
悟飯たちは、ナメック星に到着したギニュー特戦隊に、すべてのドラゴンボールを強奪されてしまう。強敵を前にベジータと共闘することを決意するクリリンだが…。
不意を突いた攻撃でグルドを倒したベジータは、リクームとの戦いに挑む！ 先制攻撃をしかけるベジータだったが、頑丈な体と超絶パワーを持つリクームには通用しない…！
ついに悟空がナメック星に到着した！ 悟飯たちに仙豆を与え、3人の命をつなぎとめた悟空は、特戦隊をひとりで片付けると豪語！ 宣言通り、リクームを一撃で倒してしまう。
悟空たちは、まだフリーザが願いを叶えていないと推察。ボール奪還への希望を見出す。一方、ジースの報告を受けたギニューは、悟空を倒すため闘いの場へと戻ることに！
ギニューは自らの戦闘力を遙かに上回る悟空の力を前に、驚きを隠せない。一方、フリーザはついに最長老のもとへ到着！ ドラゴンボールの使い方を聞き出そうとするが…。
ギニューのボディチェンジが炸裂し、悟空はギニューと体が入れ替わってしまう！ 一方、悟飯たちはフリーザの隠したドラゴンボールを発見。願いを叶えようとするのだが…。
ギニューは悟空と体を入れ替えたが、精神と肉体が一致しないため、本来の力を引き出すことができない。窮地に陥ったギニューは、今度はベジータの体を奪おうとする。
ついにナメック星の神龍が出現する。さっそく3つの願いを叶えようとする悟飯たちだが、1つの願いで生き返らせることが出来るのは１人だけ。迷う悟飯の心に、ピッコロが語りかける。
甦ったピッコロは、悟飯たちのもとへ向かう途中、瀕死のネイルを発見！ ネイルと同化してパワーアップを果たす。一方の悟飯たちは、フリーザの強大な気に圧倒されていた。
フリーザの凶刃にクリリンが貫かれた…。その光景に怒りを爆発させた悟飯は、フリーザに猛攻をしかける。だが、攻撃は通用せず、さらにフリーザの怒りを買ってしまう！
ついに到着したピッコロがフリーザと対決！ 悟飯たちは、フリーザと互角の闘いを繰り広げるピッコロの姿に希望を見出すが、フリーザは依然として余裕の態度を崩さない。
二度目の変身を遂げたフリーザが、ピッコロを窮地に追い込んでいく…。怒った悟飯が渾身の気功波を放つものの、フリーザには通用せず、簡単に跳ね返されてしまう！
デンデの力で復活し、自分は超サイヤ人になったと確信したベジータは意気揚々とフリーザに闘いを挑む。だが、フリーザとの実力差に絶望。完全に戦意を喪失してしまう。
フリーザがベジータに止めを刺そうとしたそのとき、傷を完治させた悟空がついに到着する。復活を喜ぶ仲間たちに、悟空はたったひとりでフリーザと闘うことを宣言する！
宇宙の命運を賭けた悟空とフリーザの最終決戦がついに始まった！ 自分と互角の闘いをする悟空の実力を認めたフリーザは、金縛りを使って一気に勝負を決めようとする！
悟空との闘いに余裕の笑みを見せるフリーザは、手を使わずに闘うと宣言！ 悟空は自らにハンデを課すフリーザに先制攻撃を仕掛ける。しかし、その攻撃はほとんど通用せず…。
悟空とフリーザ…互いに隠していた実力に差がありすぎた。悟空は、フルパワーの50％しか出していないフリーザに一気に劣勢へと追い詰められる。悟空に勝機はあるのか…？
絶体絶命の悟空は、最後の切り札として元気玉にすべてを賭ける！ 悟空はフリーザの猛攻に耐え、決死の覚悟で元気を集めるのだが、完成直前でフリーザに気付かれてしまう。
悟空の特大元気玉を食らってもなお、フリーザは生きていた！ フリーザになすすべもなく倒されていく仲間たち…。その光景を目の当たりにし、悟空の怒りは限界を突破する！
悟空はついに伝説の戦士・超サイヤ人へと覚醒した！ 悟飯にピッコロを連れて地球へ戻るように促すと、驚異の力でフリーザを圧倒する！ だが、フリーザはその自信を崩さず…。
フリーザの放ったエネルギー弾は、ナメック星の中枢を破壊！ ナメック星の爆発まで、残り5分となってしまう。悟空は残り時間でフリーザとの決着をつけるべく、最後の闘いに挑む！
ナメック星の爆発が迫る中、フリーザと悟空の闘いは熾烈を極める！ その頃、地球では、ヤムチャたちを生き返らせるため、ミスター・ポポがドラゴンボールを集めていた。
フリーザの攻撃を受け、悟空の気が消えたことを察した悟飯は、ブルマの制止を振り切ってフリーザのもとへ向かう。悟飯は決死の覚悟で、フリーザに闘いを挑むのだが…。
ポルンガへの願いが叶い、ナメック星には悟空とフリーザのみが残された。闘いはさらに激化していくかと思われたがフルパワーの反動でフリーザの気が徐々に減りはじめ…。
自らの技で自滅し、瀕死となったフリーザは、悟空に命乞いをしてかろうじて命を繋ぎ止める。だが、フリーザは敗北を認めず、立ち去ろうとする悟空に最期の一撃を放つ。
悟空はナメック星の爆発とともに、宇宙へ散った…。界王からその事実を聞いたヤムチャは、悲しみをこらえながらも地球にいるブルマに、一連の出来事を伝えるのだが…。
ナメック星での激闘の末、悟空によって倒されたフリーザが、機械の体を手に入れて復活！ 悟空へ復讐するため、父であるコルド大王とともに、宇宙船で地球へ襲来する！
地球滅亡を企むフリーザ一味の前に、突如として謎の少年が現れる。少年はフリーザの部下を一瞬で倒すと、超サイヤ人へと変身！ さらに、フリーザまでも一撃で倒してしまう！
謎の少年の言葉通り、悟空が地球へ帰還！ トランクスと名乗る少年は、自分が20年後の未来から来たベジータの息子であることを悟空に告げ、さらに衝撃の事実を語り出す…。
悟空は、ナメック星脱出時の出来事を語るとともに新ワザの瞬間移動を披露。その能力に仲間達は驚く。そして戦士たちは未来を変えるため、３年後の再会を誓い合う。
修行を終え、約束の場所に集合した悟空たちだったが、トランクスが予告した時間を過ぎても、敵の気配は感じられない。すると突然、ヤジロベーのスカイカーが爆発する！
悟空は姿を現した人造人間に、ヤムチャを傷つけられて激昂！ 決着をつけるべく闘いを挑む。超サイヤ人になった悟空は一時的に19号を圧倒するが、徐々に防戦一方となり…。
悟空は心臓病で本来の力が出せず、19号にパワーを吸い取られてしまう。絶体絶命かと思われたその時、ベジータが悟空を救出！ 超サイヤ人に変身し、19号に猛攻をしかける。
ベジータの圧倒的なパワーを見た20号は、荒野へ逃走！ 戦士たちのパワーを吸い取り、自分のものにしようと画策する。20号はまず、近くにいたピッコロの背後に近づき…。
ピッコロの猛攻から逃れた20号は、人造人間17号と18号を起動するため研究所へ向かう。戦士たちは、20号より先に研究所を探し、人造人間を破壊するため再び追撃を始める。
研究所へ到着したピッコロたちだったが、時遅く17号と18号が目覚めてしまう。17号は生みの親であるドクターゲロを破壊！ 眠っていた人造人間16号を起動させてしまう。
悟空抹殺のため行動を開始した人造人間に、ベジータが闘いを挑む。単身18号と闘うベジータは互角の勝負を続けていたが、無限のスタミナを持つ18号に徐々に押され始め…。
あまりにも強大な人造人間の力に、なす術なく敗れた戦士たち。ピッコロは悟空を安全な場所に移すようクリリンに伝えると、ある決意を固め、ひとり神様の神殿に向かう。
人造人間から逃れるため、クリリンたちは悟空をカメハウスに運ぶことに。するとブルマから、トランクスが乗ってきたタイムマシンに似た乗り物を発見したと連絡が入る。
タイムマシンの中で、不気味な卵を発見した悟飯たちは、さらに奇妙な生物の抜け殻を見つける。その頃、ジンジャータウンという町で、住民が忽然と消える事件が発生する。
神様と合体し、ジンジャータウンへ向かったピッコロは、町の人々を襲う怪物と遭遇！ 悟空やフリーザの気を持つ怪物は、ピッコロの生体エキスを奪うため闘いを仕掛けてくる！
ピッコロは、セルと名乗る怪物の生い立ちと目的を聞き出すことに成功！ クリリンとトランクスが現場に駆けつけたため、不利だと判断したセルは、太陽拳を使い逃亡する。
ピッコロたちと別れ、ドクター・ゲロの研究所を訪れたクリリンとトランクスは、幼体のセルを発見し、破壊する。その際入手した17号の設計図は、ブルマに届けることに。
復活した悟空は悟飯たちを連れて、1日で1年分の修行ができる「精神と時の部屋」に入ることを決意する。一方人造人間たちは、悟空を追ってカメハウスへと向かっていた。
激闘を続けるピッコロと17号は、強大なパワーが仇となり、セルに居場所を発見されてしまう。その頃カメハウスには、人造人間を停止させるコントローラーが完成したとの連絡が！
ピッコロと17号の前に、人間の生体エネルギーを吸収して急激にパワーアップしたセルが姿を現した！ ピッコロは人造人間の吸収を阻止するため、セルに攻撃を試みるが…。
ピッコロを倒したセルは、17号に攻撃開始！ 17号を吸収しようとした時、16号が17号の窮地を救う。16号は一時はセルを食い止めたものの、隙をついたセルが17号を吸収して…。
天津飯は18号を逃すため、パワーアップしたセルに新気功砲を放ち続けるが、ついに力尽きてしまう。その頃、ベジータ親子が修行を終え、精神と時の部屋から戻ってくる。
悟空と悟飯が精神と時の部屋に入る。その頃、18号を探して島を破壊するセルの前にベジータ親子が登場！ 余裕の表情を見せるベジータは、驚異的なパワーでセルを圧倒する。
ベジータとの実力差にセルはショックを画せない。だが、18号を吸収すれば勝てるはずだ…。一方、クリリンはセルの野望を阻止するため、18号を破壊しようと画策する。
強い相手と闘いたいベジータは、セルを完全体に進化させようとする。最悪の事態を恐れたトランクスたちは全力で抵抗するが、セルは隙をついて18号を吸収してしまう！
完全体となったセルは、あっという間にクリリンを倒し、次のターゲットをベジータに定める。セルの挑発的な態度に冷静さを失ったベジータは、怒りの攻撃を繰り出すが…。
ベジータは渾身の必殺技を放つものの、セルには通用せずついに敗北してしまう。倒れたベジータの姿を見たトランクスは、秘めていた力を解放してセルに立ち向かう！
力を解放したトランクスはセルに全力で攻撃をしかける！ しかしその攻撃は、ことごとくセルにかわされてしまう。それどころか、セルに致命的なミスを指摘されてしまい…。
セルは自分の力を誇示するため、武道大会・セルゲームを開くことを思い立つ。そしてテレビ局を乗っ取り、自分が勝ったら人類すべての生命を奪うことを全世界に宣言する。
セルゲームに向けて修行をするため、ベジータたちは天界に到着。そこに、精神と時の部屋での修行を終えた悟空と悟飯が現れる。悟空はセルに会うため、会場へ降り立つ。
悟空たちは闘いまでのわずかな間、休息を楽しむ。その最中、防衛軍がセルに攻撃したことを知った悟空は、セルに殺された人々を甦らせるべくドラゴンボール復活を考える。
地球の新たな神様を探す悟空は、界王様の協力を得てナメック星に瞬間移動する。神様になる素質を持ったデンデを連れて地球に戻り、ドラゴンボールを復活させてもらう！
ついにセルゲームが開幕！ 悟空たちの制止も聞かず、格闘技の世界チャンピオンであるミスター・サタンが無謀にもセルに挑む！ すると突然、会場上空にヘリコプターが現れ…。
サタンが敗れ、いよいよ悟空とセルの闘いが始まる！ 2人は開始直後から凄まじいバトルを繰り広げる。セルの強さを確認した悟空は、ついに真の力を解放することに！
悟空とセルの闘いはさらに激しさを増していく。闘いに場外負けは不要だと考えたセルはリングを破壊！ 熾烈を極めるバトルの中、悟空は渾身のかめはめ波を放つ。
ここまで全力の闘いを続けていた悟空に、徐々に疲れの色が見え始める。すると悟空は突然降参を宣言！ 仲間たちが驚きを隠せない中、次の挑戦者になんと悟飯を指名する。
ついに悟飯とセルの闘いが始まる！ 自分の秘めた力でセルを殺したくないと闘いを拒否する悟飯に対し、セルは容赦ない攻撃を続ける。するとセルの虚をつき16号が現れ…。
セルに抱きつき16号は自爆を試みるが、爆弾は外されており失敗してしまう。そしてセルは16号を粉砕し、セルジュニアを生み出すと、闘いを見守る悟空たちを襲わせる。
16号の最期の言葉を聞き、怒りが頂点に達した悟飯はついに真の力を解放する。瞬く間にセルから仙豆を奪い返すと、悟空ですら苦戦したセルジュニアたちを瞬殺していく！
セルジュニアを撃破した悟飯は、フルパワーのセルをも圧倒。絶え間なく攻撃をヒットさせていく。すると防戦一方になったセルは、なんと18号を吐き出してしまう！
第２形態へと戻り、勝ち目がないことを悟ったセルは、身体を膨らませて自爆しようとする。ピッコロたちが絶望する中、なんと悟空はセルを連れ、界王星へと瞬間移動する。
自爆から復活したセルは、闘いに終止符を打つため、超巨大なかめはめ波を撃とうとする。凄まじい気に圧倒される悟飯だが、悟空の声に励まされ超かめはめ波で対抗する！
セルは消滅し、闘いは終わった。悟飯たちはドラゴンボールで悟空を復活させようとするが、その願いは叶えられない…。すると、あの世の悟空からメッセージが届いて…。
悟飯たちと別れ、未来の世界へと戻ってきたトランクスは、破壊を尽くす17号や18号と闘う。トランクスは過去での修行の成果により、人造人間を難なく倒すことに成功する。
セルとの激闘から7年が経過した。孫悟空の息子・孫悟飯は16歳となり、サタンシティのハイスクールに通うことになった。通学の途中、悟飯は強盗事件を解決。その活躍から、正義の味方・金色の戦士の噂が広まる。
サーカス団に捕まり見世物となった怪獣・チビを悟飯はグレートサイヤマンに変身して救出。だが、泥棒扱いされて、ビーデルと闘うことになってしまう。そこへチビの親が現れて、ビーデルを急襲するのだが…。
天下一武道会を控える中、悟飯は弟の悟天が超サイヤ人に変身できるのを知り驚愕する。また、悟飯の元へビーデルが空の飛び方を教わろうと押し掛けてきた。一方、トランクスも超サイヤ人に変身し…。
悟飯から舞空術の指導を受けたビーデルは、空を飛ぶのが上達した。天下一武道会当日、ベジータ、ピッコロ、クリリンなどドラゴンチームの面々が会場に集合。そこへあの世から悟空も帰ってきて…。
天下一武道会・少年の部が始まる。トランクス、悟天は決勝戦に進み、観客は2人の強さに驚くばかりだ。トランクスは気功波を撃ち、悟天もかめはめ波を放つ。接戦の中、悟天が勢い余って観客席に足を着き…。
少年の部優勝者のトランクスがアトラクションでミスター・サタンと対戦。また、悟天とトランクスは大人の部に参加しようと、覆面選手となった。一方本選トーナメントは、悟空の対戦相手がベジータに決定する。
天下一武道会、大人の部が開幕し、第1試合でクリリンはプンターを撃破。続くピッコロは試合を放棄。そして、ビーデル対スポポビッチは、ビーデルがダメージを受けないスポポビッチに追い詰められていき…。
スポポビッチの攻撃でビーデルはボロボロだ。悟飯が乱入しようとするが、寸前でビーデルは場外負け。続く第4試合で、悟飯は相手のキビトから超サイヤ人になれと言われる。そこへヤムーとスポポビッチが乱入する。
悟空たちは界王神からブウという魔人を復活させようとたくらむバビディの存在を知らされる。バビディはブウを復活させるために巨大なエネルギーを集めていた。そんな中、悟空たちはバビディの宇宙船を発見する。
悟空たちをダーブラが急襲。クリリンとピッコロは石にされてしまう。石になった2人を元に戻そうとして、悟空たちはバビディの宇宙船に侵入。船内の階層ごとのバトルステージ戦士たちを倒し、最下層を目指す。
第1ステージでベジータの強さに驚いたバビディは、魔法で舞台を惑星ズンに変える。だが、ベジータはプイプイを撃破。第2ステージに送り込まれた魔獣・ヤコンの対戦相手は悟空だった。悟空は超サイヤ人となり…。
悟空たち不在の天下一武道会。残った選手5人によるバトルロイヤルで勝者が決まる。試合開始後すぐにマイティマスクがキーラを、18号がジュエールを倒す。マイティマスクと18号はミスター・サタンを無視して…。
激戦を繰り広げるマイティマスクと18号。マイティマスクに変装している悟天とトランクスは超サイヤ人に変身するが、そこで正体がバレてしまう。18号が気円斬を放ったことで、マイティマスクが真っ二つになり…。
天下一武道会の優勝は18号とミスター・サタンのどちらかとなった。18号は2千万ゼニーで負けると持ち掛け、サタンはそれに応じる。一方、宇宙船では第3ステージにダーブラが現れ、悟飯との闘いが始まる。
悟空との決着を心待ちにしているベジータはダーブラに苦戦する悟飯に怒る。ダーブラは、そんなベジータの邪心を感じていた。ダーブラは悟空たちと同士討ちをさせ、そのエネルギーによってブウを復活させようとする。
悟空を本気にさせようと、ベジータはわざとバビディの術にかかり、天下一武道会の観客席にエネルギー弾を撃つ。これで悟空はベジータと闘うことを決意。バビディはベジータに界王神を片付けるよう命令するのだが…。
悟空とベジータの闘いは激しいバトルとなった。一方、悟飯、界王神とバビディ、ダーブラが対峙。闘おうとすると、悟空とベジータのぶつかり合いによってブウ復活のエネルギーが満タンになってしまい…。
悟空対ベジータは激戦となった。一方、ブウの封印されている玉から煙が噴出。ブウの玉に悟飯はかめはめ波を撃ち続けるが、玉は割れてしまう。だが、中身は空だ。悟飯は凄まじい気が膨れ上がっていることを感じ…。
復活したブウは、自分をばかにしたダーブラを一蹴する。その頃、ベジータと戦っていた悟空もブウの気を感じ、ベジータに共闘を持ち掛ける。だが、ベジータは隙を突いて悟空を気絶させ、1人で魔人の元へ向かった。
悟空は悟天たちのフュージョン完成までに、死者を神龍に復活させてもらおうとした。だが、ブルマたちがドラゴンボールによって人々を生き返らせてしまう。蘇ったキビトは界王神を救い、さらに悟飯を探し出した。
バビディのメッセージによって、人々はパニックに陥る。その頃、界王神界に連れて来られた悟飯はキビトの力で復活。界王神はブウを倒すため、悟飯に伝説の剣・ゼットソードを引き抜くよう促す。
訃報を聞いたブルマたちが悲しむ中、界王神界では悟飯がゼットソードを引き抜くことに成功。だが、剣は重く振りづらい。一方、バビディとブウを倒すべく、悟天とトランクスはフュージョンをマスターしようとする。
ドラゴンレーダーを探すトランクス。一方、超サイヤ人3に変身した悟空はブウを攻めるが、ブウはほぼダメージを受けない。トランクスが西の都を出ると悟空は神殿に戻り、これにバビディはブウを咎め…。
バビディを殺したブウは、次々と街を破壊。悟空は神殿に戻ったが、残り時間は30分だ。そこへドラゴンレーダーを携えてトランクスが帰ってきた。悟空は悟天とトランクスにフュージョンをマスターさせようとして…。
悟天とトランクスがフュージョンの特訓をしている頃、地上ではブウが大暴れし、人々を粘土にして家を造っていた。一方、悟空はエネルギーを大きく使い果たしてしまい、予定よりも早くあの世に帰ることになった。
悟空は瞬間移動で、修業中の悟飯と再会を果たす。悟空はゼットソードを使いこなせるようになった悟飯と剣の切れ味を試すことにするが、剣が折れてしまう。そこへ15代前の界王神と名乗る老人が登場する。
ピッコロの厳しい特訓を終えた悟天とトランクスだがフュージョンを2度失敗する。3度目で成功し、合体超戦士・ゴテンクスが誕生。ゴテンクスは超サイヤ人にならなくてもブウを倒せると、神殿を飛び出していった。
悟天とトランクスは、ゴテンクスに変身してブウに挑むが、完敗してく帰還。一方、ブウにより絶滅の危機にある人類は、ミスター・サタンに望みを託す。ブウの住み家にたどり着いたサタンは、ブウに取り入って…。
悟天とトランクスは超ゴテンクスとなるが、ブウの家に到着するやいなや合体が解けてしまう。ブウはサタンの説得で、殺人や街の破壊をしないと誓うが、懐いた子犬が男による凶弾で倒れるのを目撃して…。
ブウに懐いた子犬が、悪党に撃たれて激怒したサタンは悪党に鉄拳制裁を加える。子犬は、ブウの不思議な力で元気な姿を取り戻す。平和な日常が戻った矢先、今度はサタンが悪党に撃たれてしまい…。
魔人ブウが2人に分裂した。無邪気なブウは一方の純粋悪のブウに闘いを挑むが力及ばず、最後に相手をチョコにする光線を放つ。だが、跳ね返されて逆にチョコにされてしまい、無邪気なブウは食べられてしまう。
ピッコロは悟天とトランクスが修業する時間を稼ぐために、ブウが地球人を皆殺しにした後での戦いを提案する。ブウは無数の気弾で瞬く間に人類を駆逐。ピッコロは、ブウに1時間の猶予をもらうことにして…。
ピッコロは精神と時の部屋へ遠回りしながらブウを案内。そして、悟天とトランクスは、完璧なフュージョンでゴテンクスに変身したのだが、繰り出す技がブウには効かない。そこでゴテンクスは、超ゴテンクスとなる。
ギャラクティカドーナツをやぶられた超ゴテンクスは、スーパーゴーストカミカゼアタックをブウに仕掛けた。ブウはオバケに触れて大爆発するが、飛び散ったブウの肉片から煙が湧き上がり、ブウは再生してしまう。
ピッコロは、精神と時の部屋の出入り口を爆破。ゴテンクス、ピッコロと一緒に閉じ込められたブウは、お菓子が手に入らないので大激怒。怒りの大声で精神と時の部屋の空間に穴を空けて脱出してしまう。
ブウに続き、ゴテンクスたちも精神と時の部屋から脱出したのだが、仲間たちはブウに食べられてしまっていた。怒ったゴテンクスは、ブウをボールにし、ピッコロとブウをバレーボールのように地上に叩きつける。
ゴテンクスがブウにとどめを刺そうとした時、時間切れで超サイヤ人3から通常のゴテンクスに戻ってしまい、フュージョンまで解けてしまう。その頃、界王神界では老界王神による悟飯のパワーアップが完了していた。
パワーアップした悟飯はブウを圧倒。追い詰められたブウは大爆発する。間一髪、悟飯は悟天たちと避難したが、ブウは姿をくらましてしまう。ブウがいない間に、悟飯たちはデンデとミスター・サタンを見つけ…。
再び悟飯たちの前に現れたブウは、悟天とトランクスを闘う相手に指名。指名された2人は超サイヤ人3に変身。ゴテンクスが攻めようとすると、アメーバ状になったブウの体の一部がゴテンクスとピッコロを吸収する。
ゴテンクスとピッコロのパワーを手に入れたブウは悟飯を傷めつける。老界王神はお宝・ポタラで悟空と悟飯を合体させ、最強の戦士を誕生させようとする。その頃、ベジータが閻魔大王に呼び出され…。
悟空は悟飯を救出し、悟飯と合体するためにポタラを投げ渡すが、悟飯は受け損ね、ブウに吸収されてしまう。悟空は合体相手を探すが、それがいない。その時、ベジータが地球に到着し、悟空と共にブウと闘うが…。
悟空とベジータが合体して、究極戦士・ベジットが誕生。ブウのエネルギー弾を跳ね返し、圧倒する。ベジットはさらに進化し、超ベジットとなった。ベジットのビッグバンアタックを受けて、ブウは瀕死となる。
ブウはスーパーゴーストカミカゼアタックでかめはめ波と魔閃光のダブル攻撃を仕掛けるが、ベジットは回避。窮地のブウはベジットをキャンディーにしてしまうが、宇宙一強いアメ玉のベジットにブウは叩きのめされる。
ブウはベジットを吸収するが、これは悟飯たちを救出するためのベジットの作戦だった。だが、ブウの体内でポタラによる合体が解け、悟空とべジータは元の姿になる。さらにベジータがポタラを破壊してしまい…。
ブウの体内で悟空たちは、ブウの分身に苦戦する。焦った悟空はエネルギー弾を乱射するがその流れ弾が、吸収され繭に包まれた太っちょのブウに当たりそうになった時、ブウの分身が遮る。ベジータは、繭を引きちぎり…。
邪悪なブウは、創造者・ビビディも制御不能となった。だが大界王神を吸収したブウは、彼の優しい性格と体型を受け継ぐ。そして、体内の太っちょのブウが引きちぎられたことによって再び凶悪な魔人に戻ったのだ。
悟空はブウと決着をつけようと気を高め、ブウを界王神界に呼び込む。悟空とベジータはじゃんけんでブウと闘う順番を決めることになった。そして、じゃんけんに勝った悟空は、全宇宙の命運を懸けてブウに挑む。
ブウと戦って力尽きた悟空を休ませるために出撃するベジータ。だが、力の差は歴然としていた。今度はベジータを救うべく悟空が割って入る。ベジータは悟空の姿を目の当たりにして、その強さを認めることになった。
ブウを倒すには、悟空が溜め込んだ気で消し去るしかない。そのための時間は1分。ベジータはその時間を稼ごうとするが、ブウの攻撃に防戦一方だった。1分が経過しても、悟空の気は十分ではなく…。
ブウが太っちょのブウを吐き出した。太っちょのブウが邪悪なブウを食い止める中、悟空は力が抜けて超サイヤ人3の変身が解けてしまう。そこでベジータはナメック星のドラゴンボールで、人々を生き返らせようとする。
ポルンガの力で地球が復活し、人々も蘇った。ベジータは悟空に元気玉を作らせ、地球人たちに力を貸せとメッセージを送る。悟飯たちの気で元気玉は膨れるが、悟空の仲間たち以外はほとんど元気を分けてくれない。
ベジータの呼び掛けを信用しない地球人だったが、ミスター・サタンの一喝で気を送り始めて、元気玉が完成した。悟空は元気玉をブウに放とうとするが、ベジータが近くに倒れているために放てないでいると…。
悟空はブウにめがけて元気玉を放つが、押し戻されてしまう。このピンチにベジータが、ポルンガへの3つ目の願いによって、悟空の体力を回復させる。悟空は渾身の力で元気玉をブウにぶつけ、ブウは完全に消滅した。
ブウとの闘いから10年後。悟飯とビーデルが結婚し、娘のパンは4歳になった。悟空、ベジータ、悟天、トランクス、そしてパンも天下一武道会に参加することを決意。悟空は、ウーブという少年と闘いたいと思い…。
天下一武道会の第1試合ではパンが勝利。次戦は悟空対ブウの生まれ変わりの少年・ウーブだ。ウーブは悟空と互角に渡り合う。その力を認めた悟空は、ウーブを鍛えるために2人で修行の旅に出ることにする。
