En naviguant, Pirata trouve un morceau de bois sculpté qui pourrait bien être un fragment de la figure de proue d'un ancien navire pirate. L'intrépide petite fille ne peut résister à la perspective de trouver un trésor. Après avoir localisé une épave avec l'aide de Capitano, Pirata veut l'explorer aussitôt malgré les mises en garde de son ami...
Pirata et son équipage remontent à bord un coffre au trésor. A l'intérieur, une énigme signée du célèbre pirate Calamar-le-Boiteux indique que les aventuriers sont très près de découvrir son trésor le plus précieux. Pirata voudrait partir à la chasse au trésor dès le lendemain à l'aube, mais Miaoucha semble décidé à empêcher tout le monde de dormir…
Chez les pirates, le premier à fouler le sol d'une île vierge et à planter un drapeau en son sommet peut la baptiser de son nom. C'est ce que veulent faire Pirata et Capitano qui viennent de découvrir une île inconnue. La course s'engage dans la bonne humeur entre les deux amis, mais un étrange pirate décide de leur mettre des bâtons dans les roues afin de parvenir avant eux au sommet de l'île...
Capitano doit livrer de nombreux colis, dont celui contenant les feux d'artifice pour la fête devant avoir lieu le soir même chez Pulpi Salma. Pirata se charge de ce colis et parie à son ami qu'elle arrivera là-bas avant lui mais des contretemps lui font prendre du retard. Afin d'arriver à temps, Pirata décide d'emprunter la terrible route des tempêtes. En perdition, le Crâne-Rose est contraint d'utiliser les feux d'artifice pour signaler sa présence…
Pirata brise malencontreusement la perle qu'elle comptait offrir à Pulpi Salma pour son anniversaire. Ne voulant pas décevoir son amie, Pirata, aidée de Capitano, part à la recherche d'une nouvelle perle...
Un capitaine-étoile de mer aurait aperçu une sirène du côté de l'Ile des Brumes Bleues. Pirata et Capitano veulent s'y rendre car Pirata est persuadée que les sirènes existent et Capitano pense que non. Une rencontre surprenante les attend...
Pirata découvre une carte indiquant l'emplacement d'un trésor appartenant à Barbe-Verte. Il serait enterré sur l'île des Trente-Récifs que l'on ne peut atteindre qu'à marée haute. Pirata se lance dans l'aventure et, lorsque le vent tombe, deux dauphins lui viennent en aide pour parvenir au rivage…
Venus fêter l'ouverture d'une taverne de plage sur l'Ile des SquelettOs, Pirata et Capitano apprennent que DelphinOs, le dauphin mascotte de l'île, a disparu, ce qui attriste grandement les autochtones. Pirata décide aussitôt de le retrouver, avec l'aide de Capitano...
En y déposant des moustiques, Dodo-le-Dur parvient à vider le Crâne Rose de son équipage et à s'en emparer. Mais Pirata ne compte pas se laisser faire. Avec Capitano à bord de l'hydravion, l'intrépide petite fille est bien décidée à récupérer son navire. Pour ce faire, elle va devoir passer à l'abordage de son propre vaisseau...
Deux ingrédients sont essentiels pour la préparation de la légendaire «soupe de moule à la Roberto» : des feuilles bleues de Gouzi et des moules de l'île du Crâne. Pirata se charge de rapporter des moules et Capitano des feuilles. Mais, tandis que la petite fille entend des bruits bizarres venant de l'intérieur de l'île, son ami, croyant récupérer une feuille, réveille le Gouza, grand oiseau bleu amateur de feuilles de Gouzi...
Pirata et son équipage doivent subir une épreuve qui permettra au Crâne Rose d'obtenir la médaille du Vaisseau d'Argent, la plus haute distinction sur l'échelle de la piraterie. Pour l'obtenir, ils doivent franchir le périlleux passage de l'Anguille à 3 têtes. Le navire suit son cap, mais des événements inattendus surgissent. Pirata peut heureusement compter sur Capitano et Ananas Wilson...
Pirata et Capitano se rendent chez Pulpi Salma pour déguster un jus de fruits. Les deux amis découvrent avec stupéfaction que Pulpi Salma est atteinte d'un phénomène étrange : elle gonfle tout en hoquetant et en faisant des bulles multicolores. Elle a en fait mal réagi à une pommade qu'elle a utilisée et souffre de «bubullite aiguë». Il existe heureusement un remède que Pirata et Capitano partent chercher...
Pirata trouve une noix de coco flottant dans l'eau avec un message de S.O.S. provenant d'habitants persuadés que leur île est hantée. Pirata et Capitano décident de se porter à leur secours bien que l'équipage du Crâne Rose ne soit pas très rassuré. Sur l'île, ils sont en effet témoins d'événements un peu effrayants...
Pirata est intriguée de voir un banc de méduses faire des soubresauts et émettre des petits éclairs électriques. Avec l'aide de Capitano, elle mène l'enquête pour en découvrir la cause. Les deux amis constatent que l'agitation des méduses est due à un bernard-l'ermite qui s'est réfugié dans une drôle de carapace...
Un voleur s'est introduit à bord du Crâne Rose pour dérober un colis que Pirata et Capitano devaient livrer...
Omar le Rouge le célèbre pirate prend sa retraite et organise une énigme pour gagner ses trésors. Pirata veut y participer mais Omar le Rouge n'admet que les pirates ayant du poil aux pattes. La petite fille décide alors, avec l'aide de Capitano, de se déguiser en garçon et de se transformer en Broc le Requin. Reste à savoir si ce subterfuge suffira à tromper le pirate...
L'hydravion, avec à son bord Capitano et Ploc, est avalé par une baleine géante. Après de nombreuses péripéties, Pirata, aidée de son équipage et d'Ananas Wilson, parvient à les libérer sains et saufs grâce à une information trouvée dans le Code du pirate...
Le jour de son anniversaire, Pirata trouve une bouteille contenant une carte au trésor et part à sa recherche. Au cours de cette aventure, elle assiste à un merveilleux phénomène naturel et découvre que Capitano et ses amis lui ont préparé cette surprise...
Parce qu'ils ont perdu une partie de «Petits bateaux» contre Dodo-le-Dur, Pirata et Capitano ont un gage : ils doivent ramener une banane à grelot avant le coucher du soleil, faute de quoi ils devront porter des chapeaux crotte de méduse, le bonnet d'âne du pirate. Les deux amis se lancent dans l'aventure mais Dodo leur a tendu un piège, la banane à grelot ne pousse que sur l'île Tintamarre, fief du terrible ogre Vacarme…
Capitano offre à Pirata un pavillon pirate ancien mais, alors que la petite fille l'admire, une mouette le lui vole. Pirata et Capitano partent à la poursuite de l'oiseau et découvrent qu'il a été dressé par Barbudo, un pirate-malfrat. Les deux amis vont dès lors tout faire pour libérer la mouette et récupérer le pavillon pirate...
A cause d'un orage, Pirata et Capitano sont contraints de poser l'hydravion en catastrophe sur une île déserte. Ils n'ont que le temps de prévenir l'équipage qu'ils étaient dans l'atoll des Mille Carats avant que leur radio ne tombe définitivement en panne. Les deux amis doivent trouver un moyen d'indiquer leur position plus précisément pour avoir une chance d'être secourus...
Sur l'Ile des SquelettOs, Roberto découvre une carte au trésor signée de SantiagOs, un de ses ancêtres, et la montre à Pirata et Capitano. Les deux amis l'entraînent aussitôt dans une chasse au trésor qui va se révéler difficile et pleine de péripéties...
Dodo-le-Dur a enlevé Miaoucha et ne la rendra qu'en échange du trésor de Cococroc qui se trouve au fond d'un «puits sans fond». Pirata, Capitano et les membres d'équipage vont tout faire pour récupérer le trésor de Cococroc et libérer Miaoucha...
Pirata participe au concours du pirate de l'année sur Barracudas. Bien que les non-pirates n'y soient pas admis, Capitano décide de s'y rendre par curiosité. Mais il se fait prendre et est accusé d'avoir volé un collier...
A la suite d'un accident, Nakunedent, qui a perdu ses dents et ne peut plus chanter et du coup déteste la musique, s'empare de la collection de dents de requin de Pirata. La fillette comprend que Nakunedent souffre de n'avoir qu'une seule dent et confie sa collection de Capitano qui va fabriquer réalise un superbe dentier pour Nakunedent...
Pirata découvre un médaillon mais Murana le lui vole car elle en possède un second. Accolés ensemble, les deux médaillons forment en effet une carte au trésor. Les pirates se battent pour le découvrir mais vont y renoncer pour sauver Dany des dents d'un terrible requin...
L'hydravion de Capitano a disparu. Embarqué à bord du Crâne Rose aux côtés de Pirata à la recherche de son trésor, Capitano, qui ne connaît pas les us et coutumes de la piraterie, enchaine un festival de maladresses qui perturbent la mission et tout l'équipage...
Afin d'avoir l'honneur de se faire tirer le portrait par Dany-le-Dandy et de figurer dans la galerie des portraits des pirates méritants, Pirata doit faire ses preuves et réussir une épreuve très délicate...
Pirata découvre un tableau représentant un pirate et une sirène. Dany se met en tête qu'il s'agit de son ancêtre et décide de partir à la recherche des sirènes. Pour cela, il vole le Lame-de-Feu. Il se met en danger au milieu des récifs...
Murana, qui ne veut pas risquer que son bateau ne s'abîme dans la passe de Barbarossa, propose à Pirata une régate qui met en jeu le bateau et l'équipage de la perdante. Pirata accepte mais Murana triche...
Le fourbe Dodo le Dur joue la comédie pour rendre Pirata responsable d'un accident. Résultat, tous les pirates de l'île Barracuda sont persuadés, à tort, que Pirata lui a cassé la jambe et détruit sa carte du trésor de Rascasse Jack...
Pirata retrouve Hippo-la-Savante son maître de cartes. Celle-ci a mis la main sur la carte de l'île au Trésor du Soleil et a besoin de son ancienne élève pour parti à sa chasse. Mais en découvrant cette île, Pirata préfère renoncer pour garder son emplacement secret et éviter qu'elle ne soit pillée...
Suite à la malédiction du triangle du Miroir, le Crâne Rose a été dédoublé et l'équipage bis répand sa bêtise et ses mauvaises blagues sur tout l'océan...
Pirata et Capitano partent à la recherche d'un brin d'or de l'île Galopagos, seul capable d'ouvrir la serrure du coffre du fameux pirate Barbe-Folle. Vont-ils y parvenir alors que l'île se déplace continuellement avec le vent ?...
Pirata et l'équipage trop absorbés par la quête de la couronne de Nacre, ne prêtent pas attention aux efforts que fait Roberto pour leur concocter de bons petits plats. Alors que l'aventure bat son plein, Roberto a le sentiment que sa cuisine est complètement ignorée et furieux, s'éloigne du groupe...
Les Piratétoiles trouvent, dans une bouteille, une carte au trésor indiquant où se trouve la légendaire île des étoiles et son mystérieux trésor. Mais Pirata refuse de chercher ce trésor pour la bonne et simple raison que, tout le monde le sait : l'île des étoiles n'existe pas...
Il faut mettre à l'abri la statue de Prior, le premier des pirates, avant que le volcan n'entre en éruption...
Pirata et Capitano découvrent un iceberg dans lequel un pirate est prisonnier. Une fois décongelé, il fait régner la terreur sur le Grand Océan et à Barracuda...
Croyant aider un naufragé dont elle a capté un S.O.S., Pirata découvre qu'elle a été appelée en fait par Murana. Fidèle au code de la piraterie, Pirata l'aide, prenant ainsi le risque de se faire doubler dans la recherche du trésor de Jack Scarotte...
Après s'être regardée dans un miroir, Plic s'évanouit et son corps se couvre d'une pellicule d'argent. Pour la sauver, Pirata doit récupérer un flacon de parfum que détient Murana...
Capitano et Ananas doivent s'éjecter de leur hydravion tombé en panne. Plongeant avec l'appareil, Ananas-Wilson se retrouve aux prises avec une pieuvre géante qui a jeté son dévolu sur l'hydravion...
Pirata et Murana sont sur la piste du butin de la pirate Sonatine Sardine. Grâce à Capitano et l'équipage soudé du Crâne Rose, Pirata a toujours un coup d'avance...
L'ogre Vacarme veut devenir un pirate. Pirata, qui doit l'entraîner, n'est pas au bout de ses peines car Vacarme n'a aucune des qualités qui caractérisent un pirate...
Lors du troc annuel de l'île de Barracuda, la louche d'or fétiche de Roberto a disparu. Soupçonnant Murana, qui s'y intéressait de près, Pirata et ses amis la confrontent. Mais cette dernière, vexée, assure qu'elle ne l'a aucunement volée...
Pirata part pour une nouvelle chasse au trésor mais doit emmener Murana avec elle car cette dernière a perdu la mémoire et s'imagine être membre de l'équipage du Crâne Rose...
Pirata sillonne le Grand Océan à bord de son vaisseau, le Crâne Rose, à la recherche de trésors enfouis. Capitano, son ami, veille sur elle.
L'équipage du Crâne Rose est témoin d'une étrange lueur progressant sous l'eau en pleine nuit. Pirata se lance sur la piste de ce mystère...
Rien ne va plus sur l'île de Barracuda où normalement les sabres sont rangés et les discordes mises entre parenthèse. Homard-le-Rouge et Cric-de-Croc, les deux pirates les plus sages du Grand Océan, se disputent à propos d'un sabre... Pire, les meilleurs amis de Pirata, Capitano et Weboo se mêlent à la bagarre...
L'île aux Mouettes est victime d'un tremblement de terre et les mouettes qui l'habitent viennent se réfugier sur Barracuda, au grand dam de Barbudo qui veut les chasser à coups de canon. Roberto se souvient alors de la légende de son ancêtre, Goélette, qui savait attirer les mouettes grâce au son de sa lyre...
Pirata veut faire une surprise à Weboo en le conduisant sur l'île de ses ancêtres. Lorsqu'il le comprend, Weboo s'en inquiète car d'après la légende familiale, elle est habitée par des fantômes. L'équipage du Crâne-Rose s'y rend et, plusieurs phénomènes anormaux semblent donner raison à Weboo...
Pirata et Capitano libèrent Barbudo prisonnier dans une grotte gardée par une pieuvre et un requin...
Pour son anniversaire, Pirata reçoit une carte au trésor. Elle se lance dans l'aventure et découvre un magnifique coquillage qui lui murmure à l'oreille : «Ramène-moi chez moi»...
