ちょっぴりドジで泣き虫な中学２年生の月野うさぎ。 額に三日月模様を持つ黒猫ルナに出会って渡されたのは、不思議なブローチだった......！
ひょんなことから、IQ300の天才少女水野亜美と急接近したうさぎ。 亜美の通う塾の生徒が何やら怪しい様子だが......。
うさぎのまわりでは仙台坂上のバスの不穏な噂で話題がもちきり。 そんな中、うさぎは黒髪の美しき巫女、火野レイと出会う。
宝石産出国、D国のプリンセスが秘宝を披露するということを聞きつけたうさぎ。 ルナは秘宝が幻の銀水晶でないかとにらみ、うさぎたちもプリンセスを調査するためD国の舞踏会に忍び込むが......！
訪れた男性が行方不明になるという「呪われたブライダルショップ」。そんな噂で持ちきりの十番中学校に長身の怪力少女、木野まことが転校してきた！
幻の銀水晶を探し、犯行を続けている人物として報道されたタキシード仮面。 ルナたちはタキシード仮面は敵だと疑うが、うさぎは信じられずにいて......。
タキシード仮面の正体が地場衛であることを知ったうさぎ。 一方うさぎの住む街では、洗脳された人々がセーラームーンを捜し求めて徘徊していた......。
セーラームーンのピンチを救ったのはなんとセーラーVだった。 セーラーVこと愛野美奈子は、クンツァイトと決着をつけるため東京タワーに向かうが......！
セーラームーンをかばい意識を失うタキシード仮面。 悲しみの感情によって、セーラームーンがプリンセス・セレニティとして覚醒する......！
幻の銀水晶の謎をつきとめるため月に降り立つセーラームーンたち。 そこで出会ったのはなんと前世のうさぎの母、クイーン・セレニティだった......！
悲しみに暮れるうさぎの前に現れたのは「遠藤」と名乗る、衛そっくりの男性だった。うさぎは衛の面影を感じ、その男性に近づくが......。
衛がダーク・キングダムの戦士となってしまったことを知らされるセーラームーン。 衛を取り戻すべく、クイン・ベリルに立ち向かうが......！
悲しき運命を終わらせるべく、聖剣を衛に刺した後、自害をするセーラームーン。倒れた２人はクイン・メタリアに飲み込まれるのだった......！
巨大な暗黒の力を放出するクイン・メタリアを倒すべく、立ち上がるセーラームーン。 ついに幻の銀水晶の力を開放する......！
空から降ってきた不思議な少女、ちびうさの正体を探るうさぎたち。 一方、文化祭が開かれるレイの学校には、新たなる敵が紛れ込んでいた......。
レイが拐われたことにより、正体の分からないちびうさに猜疑心を抱くうさぎ。 一方、亜美はチェスの世界大会で怪しい女性に勝負を挑まれる......。
亜美とレイの居場所をつきとめようとするうさぎたち。 その姿を目撃した衛の後輩、浅沼一等に、自身の正体について問い詰められたまことは……！
異世界の人と交信する「チャネリング」の会に潜り込む美奈子。 そこでチャネリングをしていた女こそ、あやかしの四姉妹の次女カラベラスだった......！
うさぎたちは、ちびうさがやってきたという３０世紀の未来へいくことに......！ そこに待ち構えていたのは孤独な番人セーラープルートだった。
セーラームーンたちの前に現れたのは未来の衛の姿、キング・エンディミオン。 彼が明かしたのは、未来の地球に起こった衝撃的な出来事だった......。
デマンドに捕われ、さらに変身する力をも失ってしまったうさぎ。 一方、ちびうさは自分の不甲斐なさを思い悩み、セーラープルートに会いに行くが……！
ブラック・ムーンの城からの脱出を試みるうさぎ。 たどり着いた「邪黒水晶の反応炉」にいたのはデマンドの弟、サフィールだった……！
行方不明となったタキシード仮面とちびうさを捜し続けるセーラームーンたち。 しかし、ワイズマンの暗躍はすでに始まっていた……。
ブラック・レディの正体がちびうさであるという事実に困惑するセーラームーンたち。 そしてついにワイズマンは、自身の本当の姿を明かす……！
銀水晶接触の瞬間、世界消滅の危機を救ったのはセーラープルートだった。 命を落とすセーラープルートを見つめていたブラック・レディは……。
巨大な暗黒の力を放つデス・ファントム。 幻の銀水晶の力を開放し、セーラームーンとセーラーちびムーンが立ち上がる……！
つかの間の平和な日々のなか、「先祖がえり」という怪物現象が起こり街は騒然となる。 うさぎ達は新設の無限学園へと偵察に向かう。
ちびうさは「土萠研究所」へ迷い込み、発作で倒れこんでいる少女と出会う。 突如怪物に襲われるちびうさと、うさぎ。 そんな中、新しいセーラー戦士の影が!
うさぎ達は無限学園の新入生合宿へ潜入。 真夜中、魂と生気「オスティ」を捧げさせる怪しい儀式を行う有村ゆうこを見つける。 新しい敵デス･バスターズとの戦いが始まる!
うさぎ達は無限学園で開催される海王みちる、羽生美々のコンサートへ。 コンサートでは美々がミメットに変身し、大混乱となる!
無限予備校で常に模試1位の美堂ゆいの挑発をうけ、無限学園に体験入学した亜美は敵に捕まってしまう。 伝説の外部太陽系戦士、彼らの真の目的とは？
照野留々が改良したテルルンという植物が生命エネルギー「オスティ」を吸い取ることを知ったまことは、うさぎ達と急ぎ無限植物園へ向かう。
土萌ほたるの秘密を見てしまったちびうさ…仲の良い二人の心に亀裂が。 そして、謎に包まれた外部太陽系３戦士の真実が語られる。
シプリン・プチロルの魔力に惑わされセーラー戦士達が互いに戦い合う中、突如３つのタリスマンが共鳴しあい、かつて無い現象が起こり始める。
一刻も早く魂を取り戻さなければ、ちびうさは死んでしまう。 超生物と化した土萌教授と戦うセーラー戦士たち、そのさなか変わり果てたほたるを見つける。
師ファラオ90の攻撃から、結界を張り必死で守る外部太陽系戦士達。 そして命がけでちびうさの魂を守ろうとするほたるの意識が…。
セーラー戦士たちが力尽きる中、スーパーセーラームーンが「幻の銀水晶」の力を解放しようと、自ら師ファラオ90へ飛び込む。 そして３つのタリスマンが共鳴し始め…!?
サターンの「沈黙の鎌」が振り下ろされ、セーラームーンも消えた。 世界の終焉を覚悟したその時、ひとつの光の塊がゆっくりと現れた！
