10-åriga Helén Nilsson försvinner påsken 1989 i det lilla samhället Hörby. Det är en kylig kväll och Helén ska träffa två klasskamrater vid lågprisbutiken några minuters promenad hemifrån men de unga vännerna möts aldrig. Sex dagar efter försvinnandet hittas Heléns sargade kropp, våldtagen och strypt. Kriminalkommissarie Pelle Åkesson vill arbeta med utredningen men blir bryskt avvisad av sin chef. När Heléns mamma dyker upp på polishuset och ber Pelle ta sig an fallet avger han löftet att hitta Heléns mördare.
Helén-utredningen går på sparlåga och Pelle Åkesson följer oroad utredningens tynande tillvaro. Två kvinnor hittas mördade och nattvandrargrupper börjar patrullera gatorna i Kristianstad. Pelle och hans team förhör misstänkta och följer upp ledtrådar men maktkamp och politiskt spel försvårar utredningen. Pelles nya kollega Monica Olheds förhörsmetoder börjar bli omtalade på polishuset och en nattvandrare fångar Pelles uppmärksamhet och tas in på förhör.
Det olösta mordet på Helén Nilsson fortsätter att plåga Pelle. För att komma vidare börjar han gräva i mordet på den prostituerade Jannica Ekblad. Utredningen leder dem till en ny misstänkt, en man kallad Grisen. Pelle vill undersöka morden parallellt men det leder till en konflikt med hans chef som får stora konsekvenser. Gruppen som kan lösa mordet på Helén sätts ur spel. Och därute går mördaren lös.
Pelle är tillbaka från sjukskrivningen och placerad i polishusets källare. I hemlighet börjar han gå igenom Helén-fallet och gruppen som kan lösa mordet återuppstår, nu börjar jakten på allvar. På en julfest blir Monica tagen åt sidan av en kvinna som berättar om en man hon tror kan vara mördaren. Hon säger att hon kontaktade polisen redan 1989.
Pelle skickar i smyg och mot sin chefs vilja DNA från Helén till ett labb i Birmingham för analys. Nu har Pelle bråttom. Det här är sista chansen, sedan kommer utredningen att stängas för alltid. Åklagaren ger Pelle klartecken att topsa en rad misstänkta för DNA. Som sista namn på listan får Monica igenom att Ulf Olsson ska topsas. Namn efter namn utesluts men äntligen får de träff.
15 år har gått sedan Helén försvann. Pelle bestämmer sig för att riva upp stugan Ulf Olsson bodde i vid försvinnandet. Den är nyrenoverad men när de bryter upp golvbrädorna hittar de spår av blod. Men ytterligare teknisk bevisning behövs för att åklagaren ska väcka åtal. Pelle åker tillbaka till Ulfs lägenhet för att se om de kan ha missat något. Där hittar han ett simkort.
Har du sett klart Jakten på en mördare? Välkommen till eftersnacket där vi tillsammans med bland andra seriens regissör Mikael Marcimain och ena manusförfattaren Helene Lindholm pratar om tv-dramat. Hur gick det till när serien kom till? Hur gör man en spännande dramaserie om så här svåra och obehagliga fall? Och så bjuder vi in Bo Wennström, svensk professor i rättsvetenskap, för att prata om polisens ständiga omorganisering och hur detta gestaltas i serien. Utöver detta låter vi två gästrecensenter hjälpa oss att analysera: SVT:s filmkritiker Fredrik Sahlin och filmvetaren Charlotte Wiberg.