Having escaped from the Virtual World in Mokuba's body, Noah sets about to shut down the system once and for all, destroying the minds of his father and everybody else in the Virtual World at the same time. Yugi and the others, meanwhile, continue to search for an exit from their virtual prison, but Kaiba is more interested with defeating his step-father once and for all. However a duel between the two relatives soon proves to be a lot more challenging than Seto could have ever expected.
Alors qu'ils cherchent à s'enfuir du monde virtuel, Yugi et ses amis sont encerclés par des monstres. Kaiba affronte Gozaburo, son beau-père, dans un combat ultime.
Anlässlich Noahs Übernahme von Mokubas Körper, versuchen Yugi und seine Freunde Mokuba zu retten. Jedoch werden sie von unzähligen Monstern attackiert. Indessen versucht Noah die virtuelle Welt in die Luft zu jagen. Um seine Freunde zu retten, sucht Seto Kaiba währenddessen seinen Stiefvater auf.
乃亜はモクバの肉体を奪って現実世界へ脱出し、要塞へ向けたミサイルのスイッチを押す。後にモクバの優しい言葉を思い出して引き返すが、ミサイルを止めることができない。一方、海馬と剛三郎はデュエルで勝負する。
بعد أن هرب نوح من العالم الافتراضي في جسد موكوبا، شرع في إغلاق النظام مرة وإلى الأبد، مدمرًا عقول والده وكل شخص آخر في العالم الافتراضي في نفس الوقت. في غضون ذلك، يواصل يوغي والآخرون البحث عن مخرج من سجنهم الافتراضي، لكن كايبا مهتم أكثر بهزيمة أبيه مرة وإلى الأبد. ومع ذلك، سرعان ما ثبت أن المبارزة بينهم أكثر صعوبة مما كان سيتو يتوقعه.