原因不明の航空機事故が続発し、郷は原因を究明する。地球磁気が熊沢ダムに集結していることが原因らしい。そこに怪獣マグネドンが出現する。地球の磁力を帯びたマグネドンに苦戦するＭＡＴに解散の危機が迫る。郷はマグネドンの攻撃により重傷を負っていたが、ＭＡＴ存続のため、再び怪獣に挑む！
