深夜のテレビ画面に、民間旅客機の爆発炎上の瞬間が映し出された。事故は電波怪獣ビーコンの仕業だった。ビーコンは空中の電波を吸収し、目に映ったものを全世界へ発信させるという、テレビ局のような機能を持つ怪獣だった。電波が飛び交う東京へと向かうビーコンを、MATは海上へ誘導しようとするが……。
