Keroro has a cavity and it is up to the platoon and the Hinatas to battle the enemy invaders in his mouth with Kururu's invention, with a slight parody of Gundam.
Hablando con Natsumi, comiendo golosinas y galletas, Keroro siente un profundo dolor en la tercera muela y Giroro se da cuenta enseguida, se trata de las temibles caries galácticas, así que evacúan la casa y empiezan la operación. Primero Kururu le hace una revisión y observa la gravedad de la situación y como es crítica, hacen una batalla anti-caries: se encogen y se meten en la boca de Keroro para luchar contra las caries. Giroro y Tamama van a luchar contra ellas pero son demasiados y demasiado fuertes así que necesitan un líder para que de órdenes a la tropa y Keroro propone ir él mismo.
Kururu inventa un clon de Keroro llamado Keroro B, que está conectado a su cerebro, solo que con pinta de robot y con una "B" en la estrella para poder introducirse en su boca. Además, Fuyuki y Natsumi también están decididos a participar en esa guerra y se introducen dentro de la boca de Keroro junto con los demás. A continuación descubren la base enemiga y descubren a la reina, con lo que se retiran, pero Keroro, a causa del dolor, no puede salir y pide a los demás que se vayan sin él. Cuando todo estaba perdido, Kururu inicia la bomba que había insertado al robot y así, vence a las caries galácticas. Al final a Natsumi le duele una caries y la tropa comienza la batalla anti-caries... otra vez.
某日Keroro突然疼痛得不支倒地，原來是得了蛀牙。Giroro判斷是細菌大小的超小型敵人進入從Keroro的口中入侵，建設基地…於是冬樹、夏美隨著Giroro等人，將身體縮小進入Keroro的口中，展開宇宙戰爭，與敵人對抗，但是敵人實在太多，Giroro他們只好撒退…
