宇宙にあがったアークエンジェルと艦艇クサナギは当面の拠点として、L4コロニー群へ。父を失い悲しむカガリは、父の最後の言葉を思い返していた。
Cagalli, though grief striken with her father's death, confronts Kira with a mysterious photograph given to her by Lord Uzumi, of a woman with two infants and Kira and Cagalli's names written on the back. On a PLANT, Lacus is still on the run for treason, but broadcasts messages to counter PLANT Supreme Council Chairman Patrick Zala's propaganda. She soon discovers that her father has been assassinated by Patrick Zala.
Obwohl Cagalli erst mit dem Tod ihres Vaters fertig werden muss, konfrontiert sie Kira mit einem alten Foto, das sie von Lord Uzumi bekommen hat. Zur gleichen Zeit werden neue Truppen in Stellung gebracht, obwohl noch sind nicht alle Beteiligten kampfbereit sind.
Alors que le Kusanagi est enfin opérationnel, Kira et Asran tentent de consoler une Cagalli minée par le chagrin et encore sous le choc des révélations que lui a faites son père. Pressé par Mu, Asran confirme son intention de combattre aux côtés de Kira et de ses amis. Pendant ce temps, sur les PLANT, Lacus continue d'organiser la résistance.
