On ne sait pas pourquoi, mais quatre jeunes gens tapent sur un autre surnommé Poubellator et finissent par le terrasser.
Poubellator, laissé pour mort dans le premier épisode, revient lancer un défi aux Bitomans : un duel dans les ruines de la mort. Les Bitomans finissent par en venir a bout en lui lançant en pleine face leur nouvelle recrue, Transpire-Man.
Incinérator, le frère jumeau de Poubellator, descend de sa planète natale Gomibako 13 avec la furieuse envie de venger ce dernier. Il enlève Transpire-Man et oblige les Bitomans à venir le sauver. Après moult combats déchaînés contre ses sbires, ils pourront enfin l'affronter dans un final épique au sein des toilettes désaffectés de son repaire.
Profitant de l'émission Vitamime sur TMC pour passer à la télé, le monstre Celulloïd annonce aux Bitomans qu'il détient le transcodeur de particules (qui permet d'atteindre la puissance absolue) et qu'il sera bientôt le maître du monde. Une fois sa 3ème mutation achevée, sa puissance est telle qu'il faudra que deux Bitomans fusionnent pour lui tenir tête.
Au cours du 48ème tournois millénaire des arts martiaux, Poseidon s'empare de l'armure d'or destinée normalement au vainqueur du tournoi. Les Bitomans ne se laissent pas faire et partent à sa recherche. Mais ce sera peine perdue : après avoir envoyé le Golgoth 27, Poseidon achève les Bitomans un par un et finira par détruire la Terre. Pour la première fois, Bitoman finit mal !
Après des milliards d'années, la Terre a reprit vie et les Bitomans se sont réincarnés. Putréfactor, le descendant de Poubellator, compte venger ses ailleux et enrôle quelques sbires pour défier les Bitomans. Chose étrange, Terry Bogard, d'ordinaire du côté de la justice, se range dans le camp de Putréfactor. Il en effet persuadé que ses compagnons Bitomans sont les assassins de son père Porco Rosso. Il s'agit pourtant d'une méprise et l'épisode se terminera avec la mort de Terry, combattant contre les autre Bitomans. Quant à Putréfactor, nul ne sait ce qu'il devient.
Buu fait un coup d'état, tue le roi du monde, en fait un zombie et s'installe à sa place. Les Bitomans partent au combat pour rétablir la justice. Dans leur périple, ils sont envoyé dans l'outre monde (bien lugubre) via une fissure temporelle et assistent impuissant à la mort de leur mascotte souffre-douleur Transpire-Man le bien nommé. Buu finira par leur envoyer son monstre géant créé à partir des cellules prélevées sur ses autres créatures. Seule solution pour les Bitomans, prendre les commande du Bitorak et en finir une fois pour toutes !
Komenor le terrible dictateur règne sans partage sur le Pays. Tandis que la tête des Bitomans est mise à prix, la Bitogirl va être fusillée sur la place publique. Malgré leur intervention, les Bitomans ne pourront la sauver. De plus, Komenor, plus fourbe que jamais, injecte à Kyô un poison mortel. Seul solution pour le sauver : trouver les quatre pierres des points cardinaux ainsi que l'artefact ultime : la Larme d'Or.
La porte de l'enfer s'est ouverte. Profitant de l'occasion, l'infâme Poubellator revient sur Terre pour se venger. Avec lui débarque quelques vielles connaissance de nos héros. Devant cet invasion de monstres, les Bitomans partent à la recherche de leurs compagnons morts au combat dans les épisodes précédents. Une fois l'équipe reformée, les voilà prêts à affronter leur ennemi ancestral.
Ils sont là, ils sont beaux, rapides, puissants et colorés. Les Bitorangers débarquent pour sauver la planète. Quand aux Bitoman, il est temps pour eux de passer le relais. La mode est désormais aux sentaï, couleurs arc en ciel et colants serrés. Les Bitoman auront fort à faire pour retrouver les sept boules de cristal et ainsi réduire à néant le pouvoir terrifiant des Bitorangers.
Chibilu l'infâme profite de la mort de Poubellator pour tenter à son tour de devenir le maître du monde. Manque de pot pour les Bitoman, il est vraiment, mais vraiment super balèze. Comment nos amis vont-ils pouvoir en finir avec lui ? Courage les Bitoman, c'est votre dernière aventure !