In einer Reihe von Rückblenden wird geschildert, wie und warum Jason Higgins zum Anführer der ersten Generation von Wayward Pines herangezogen wurde. Derweil taucht Schwester Pam wieder auf und wird für die Stadt zu einer tödlichen Bedrohung. Theo wiederum beschäftigt nach wie vor eine Frage: Warum wurde ausgerechnet er als einer der Bewohner von Wayward Pines ausgewählt?
Nurse Pam reappears as a lethal threat to the city; Jason's past is revealed.
Mutantit vaikuttavat kadonneen., joten Jason suunnittelee siirtokunnan laajentamista aidan ulkopuolelle ja miettii, ketkä pitäisi lähettää maastoon ensimmäisten joukossa.
Une patrouille de soldats explore l'extérieur pour confirmer la fuite des Abbies. Un nouvel échange a lieu entre Jason et Kerry, qui lui reproche la mort de Ben. Rebecca explique à Theo que Jason est un "Élu" désigné pour les diriger. On découvre ensuite l'enfance de Jason, premier enfant réveillé et élevé pour être le leader. Dans sa maison, Jason reçoit la visite de Pam qui tente de lui rappeler les principes initiaux du projet, et lui propose son aide.
Le lendemain matin, Jason se rend dans la Rue Principale afin d'officialiser le retour de Pam, ce qui semble déplaire fortement à Megan. Plus tard, Theo a une discussion avec Pam, qui semble très mystérieuse à propos de la dernière nuit à Hawaï.
Pam retourne ensuite à la base de Pilcher afin de poursuivre ce qui semble un plan bien réfléchi, mais elle y est surprise par Megan au moment où elle dérobait un flacon, et une discussion agitée démarre entre elles. Plus tard, on retrouve Pam chez elle en train de se préparer une injection, mais Theo arrive et interrompt son geste en l'interrogeant sur leur choix des "candidats". Theo parti, elle finit tout de même par s'injecter le produit, qui semble être le virus de la variole. Arrêtée, Pam dévoile son plan d'éradiquer toute la population afin de mettre fin au projet, et avoue à Jason qu'il est son fils.
סדרת פלשבקים חושפת כיצד הפך ג'ייסון היגינס, הילד המועדף על תושבי וויוורד פיינס, להיות מנהיגם של הדור הראשון.
A rengeteg visszaemlékezésben megtudjuk, hogy Jason Higgins-t, hogyan nevelték fel arra, hogy az első generáció vezetője legyen Wayward Pines-ban. Ez idő alatt, Pam nővér tovább kutakodik a városban, és kideríti, hogy mi szerint választották ki őt arra, hogy Wayward Pines részese legyen.
L'infermiera Pam torna a farsi viva in città, apparentemente per farsi accettare dalla comunità. Ma le sue reali intenzioni sono ben altre.
In het verleden is Jason opgevoed om de leider van Wayward Pines te worden als er iets zou gebeuren met David Pilcher. In de huidige tijd is Jason verrast als een van zijn mentoren om vergiffenis vraagt en zich weer bij de gemeenschap wil voegen.
Разведка подтверждает, что абби отступили, и руководство начинает задумываться о том, как воспользоваться этой ситуацией. Между тем Джейсон сообщает, что простил Пэм за ее поступок, и разрешает ей вернуться к делам.
La enfermera Pam vuelve a surgir como una amenaza letal para la ciudad; el pasado de Jason es revelado.
I en serie av tillbakablickar får vi veta hur och varför Jason Higgins valdes till att vara ledare för Wayward Pines.
W serii retrospekcji dowiadujemy się, dlaczego Jasona Higgingsa wychowywano na przywódcę pierwszego pokolenia i traktowano jako uprzywilejowane dziecko w Wayward Pines. Tymczasem w miasteczku pojawia się ponownie siostra Pam, stanowiąc zabójcze zagrożenie dla wszystkich żyjących mieszkańców. Theo nadal stara się dociec, dlaczego został wybrany, by stać się częścią populacji Wayward Pines.
