Während sich Jack, Miko und Raf mit Arcee, Bulkhead und Bumblebee amüsieren, entdecken Optimus und Ratchet, dass es sich bei der Substanz, die Arcee aus der Energonmine der Decepticons mitgebracht hat, um dunkles Energon handeln muss. Optimus vermutet völlig richtig, dass Megatron damit eine Armee der Untoten erschaffen will, um den Planeten zu erobern.
Als alle wieder auf dem Stützpunkt sind, macht sich Optimus mit Ratchet auf den Weg, um mehr darüber herauszufinden. Auch Arcee und Bumblebee machen sich kurz darauf aus dem Staub, und Bulkhead bleibt mit den Kindern allein zurück.
Als wenig später Agent Fowler auftaucht, entdeckt er die Kinder, und will sie in Gewahrsam nehmen. Doch das weiß Bulkhead zu verhindern.
The Decepticons, in order to find the Autobot base, capture and torture Secret Agent Fowler, and it's up to Bulkhead and the three human kids to track him down. Meanwhile, Megatron raises an army of undead Transformers.
Bulkhead part sauver l'agent Fowler, qui s'est fait kidnapper par les Decepticons. Les choses se compliquent quand il remarque que Miko l'a suivi...
Az autobotok "sötét energon" jelet mérnek be, ezért Optimus Prime és Ratchet elmennek a bázisról, hogy vizsgálják Megatron tevékenységét. Ezután Arcee és Bumblebee elindul járőrözni. Így Bulkhead, Jack, Miko és Rafael a bázison maradnak. Eközben William Fowler ügynököt (aki az autobotok kapcsolattartója a kormánnyal) Soundwave elfogja, Starscream parancsára, aki meg szeretné tudni, hogy hol van az autobot bázis. Bulkhead elindul kiszabadítani őt az álcák fogságából, de a gyerekek is követik.
Approfittando del momento di relativa calma dopo gli ultimi eventi, Jack sfreccia a bordo di Arcee lungo una strada nel deserto che circonda Jasper; Miko invece si gode dall'interno di Bulkhead l'esperienza di lanciarsi a rotta di collo lungo il fianco di una ripida collina; il più tranquillo Raf, dal canto suo, si limita a sfidare Bumblebee a un videogioco di guida, perdendo clamorosamente la partita.
Ratchet intanto viene aggredito dal pezzo di apparecchiatura rotto da Bulkhead, che l'Energon Oscuro ha reso una creatura viva: Optimus Prime lo neutralizza con un colpo del suo fucile laser. L'evidenza di quanto accaduto pone i due di fronte alla minaccia del nuovo minerale in possesso di Megatron.
Il Comandante dei Decepticon assapora il potere che ha acquisito dopo aver inserito la scheggia di Energon Oscuro direttamente nel suo petto: ora che sente rifluire dentro di sé l'energia sa perfettamente quale dovrà essere la prossima mossa e così, dopo aver ordinato a Starscream di restare in attesa di nuove disposizioni, abbandona l'astronave Nemesis.
Rimasto solo, Starscream viene avvicinato da Soundwave, al quale confida i suoi timori circa la nuova condotta di Megatron, che sembra ormai aver perso la capacità di giudizio. Per tutta risposta, l'ufficiale delle comunicazioni gli ripropone l'audio con le ultime parole di Megatron, ricordandogli che deve restare in attesa di nuove disposizioni e non prendere iniziative. Ma Starscream non vuole restare inattivo e pensa a un modo per agevolare la distruzione degli Autobot.
Optimus Prime e Ratchet discutono dell'Energon Oscuro e dei piani di Megatron: Optimus ha infatti capito che il nemico intende conquistare il pianeta utilizzando un'armata di guerrieri defunti, ipotesi che sembrerebbe però difficile da realizzare sulla Terra, dove non esistono abbastanza cybertroniani utili allo scopo. Poiché Arcee, Bulkhead e Bumblebee devono restare insieme ai piccoli amici umani e vigilare sulla loro incolumità, Op
Al darse cuenta de que Megatrón ha descubierto Energon Oscuro, Optimus y Ratchet deciden ir a investigar a un lugar en donde hace tiempo se había librado la mayor batalla entre ambos bandos en esta galaxia. Mientras que el Agente Fowler es secuestrado por Decepticons, Bulkhead decide ir a rescatarlo y Miko va oculta atrás de él, luego Jack y Raf van tras ella y son secuestrados por Decepticons. Mientras, Megatrón levanta a un ejército de Zombies Robots controlados por el Energon Oscuro para que acaben con Optimus y Ratchet.
Bulkhead ma uratować agenta Fowlera porwanego przez Decepticony. Potajemna interwencja Miko powoduje komplikacje.