Dregg hires an alien bounty hunter named Medusa to help capture the Turtles. The Turtles must fight off this new threat. Meanwhile, Carter realises that he is more of a hindrance than a help. Meanwhile, an alien slug, called a Slorr, hatches & begins terrorising the city.
Creyendo que las Tortugas son lo único que se interpone entre él y la dominación total del planeta, e incapaz de obtener el tan necesitado Mineral de Neutronium, Dregg hace contacto con un viejo aliado: Medusa, una alienígena siniestramente hermosa. Dregg emplea a Medusa para eliminar las tortugas por él. Entonces, mientras Medusa atrae a las tortugas a una pelea en la planta hidroeléctrica, Hi-Tech lleva con éxito a los Technogangsters a la mina de Neutronium, donde son libres de continuar su trabajo. De vuelta en la planta, el mutante Carter casi destruye la presa (lo que habría causado la pérdida de miles de vidas) y en la confusión, Medusa captura a Leonardo. Parece que ella tiene la intención de venderlo a él y a las otras tortugas como mano de obra esclava en otra parte de la galaxia. Carter, ahora de vuelta a su estado normal, se culpa por la desaparición de Leonardo. Se da cuenta de que necesita pasar más tiempo entrenando con Splinter para aprender a controlar su mutación.