La Build Base è stata devastata dall'attacco della nave Yamata no Orochi, ma il personale si è salvato nella sezione sotterranea dell'installazione, perfettamente operativa e funzionante. Durante l'ultimo conflitto sono state mosse energie inconcepibili e la zona di stasi è stata pressochè dissipata. Dai contatti con le Forze di Difesa si apprende che le comunicazioni sono totalmente funzionanti, la zona è divenuta accessibile ma non vi è traccia della presenza di Himika, pertanto si decide di chiamare in causa la Build Station, la base spaziale comandata dal professor Dairi. Nel frattempo il professore si sta occupando di Hiroshi, il quale ha recuperato pienamente: una lesione al nervo ottico gli impedisce temporaneamente di vedere ma la sue condizioni sono eccellenti. Il ragazzo può così riabbracciare la madre e la sorellina, ma soprattutto Miwa, la quale attendeva questo momento da 50 anni, una lunga attesa che ha segnato il suo volto. Attraverso la vista offuscata Hiroshi intravede i lineamenti non più giovani della compagna che si ritrae per la vergogna e dispiacere ma non c'è amarezza nel sorriso sincero del ragazzo che sussurra: "Sono ritornato, Micchi.". Kenji intanto si dispera per aver perso il potere che consentiva alla sua Raikoba di trasformarsi nell'abitacolo di Jeeg e i nomerosi tentativi portano solo a inevitabili fallimenti. E sul campo di allenamento avviene uno storico incontro: Kenji il pilota del nuovo Jeeg incontra Hiroshi, colui che incarnava il robot nella sua prima veste. Il figlio di Shiba racconta al giovane la natura delle Campane di Bronzo, che costituiscono il nucleo di Jeeg, senza le quali non è possibile trasformarsi nel robot: Hiroshi racconta gli ultimi momenti della battaglia contro Himika sul monte Aso, ma i ricordi gli sfuggono. Ora è necessario concentrarsi e capire che strategia adottare per affrontare il regno Jamatai, privi del sostegno di Jeeg. Kenji allora, ripensando alle ultime parole di Kyo, incontra Tsubaki,
つばきと宙を救出したものの、阿蘇に散った鏡…。二つの銅鐸のパワーを得た妃魅禍が、遂に結界の呪縛から解き放たれた。そして、九州全域に大空爆を行った妃魅禍は、八岐之大蛇で何処かに消えてしまう。 ビルドステーションの大利博士と連絡をつけた遷次郎は、すべての残存兵力を率いてビルドシャトルで宇宙に飛び立つ!