Dr. Nicholas Rush (Robert Carlyle) und Chloe (Elyse Levesque) werden von schlimmen Alpträumen heimgesucht. Diese Träume sind erstmals nach ihrer Gefangenschaft auf dem Raumschiff der Außerirdischen aufgetreten. Deshalb hegt Rush einen Verdacht: Möglicherweise ist irgendwo auf der Destiny ein Peilsender versteckt. Col. Young (Louis Ferreira) und Lt. Scott (Brian J. Smith) schenken dieser Theorie Glauben und lassen eine Suche im Schiffsrumpf durchführen. Schon bahnt sich die nächste Gefahr an: Eine Gruppe von Besatzungsmitgliedern droht mit Meuterei.
Dr. Nicholas Rush and Chloe suffer nightmares following their ordeal on the alien vessel, and Rush suspects that a tracking device may have been placed on the ship's hull. Later, a splinter group on Destiny executes a coup with life-threatening consequences.
Camille et Rush décident de prendre le contrôle du vaisseau alors qu’une menace extérieure apparaît.
Molti dei civili sulla Destiny si ribellano e tolgono il controllo della nave al personale militare.
Благополучно вернувшись на корабль, Хлоя с Рашем, тем не менее, никак не могут пережить кошмар, связанный с их недавним положением. Ученый полагает, что инопланетяне нашли «Судьбу» благодаря спрятанному на борту маячку, и начинает поиски устройства. Параллельно Николас объединяется с Камиллой, чтобы вместе поднять восстание против командования Янга и захватить власть, что едва не приводит к гибели Эверетта и Мэттью, и портит отношения между другими членами экипажа.
Nicholas Rush y Chloe Armstrong sufren pesadillas después de su paso por la nave extraterrestre, y Rush sospecha que un dispositivo de rastreo puede haber sido colocado en el casco de la Destino, porque está convencido de que los aliens están más interesados en la nave que en ellos y que la siguen desde antes de que ellos acabaran allí. Más tarde, un grupo disidente del equipo civil de la Destino ejecuta un golpe, dejando sin el control al personal militar, con consecuencias que amenazan vida de los pasajeros de la nave.
Chloe a doktor Rush se ocitají zpět v bezpečí na lodi Destiny. Oba jsou ale pronásledováni nočními můrami, které přičítají nedávným věznitelům, kteří je zkoumali. Rush tvrdí, že jediná věc, kterou mimozemšťané chtějí, je sama loď Destiny. Posléze zjišťují, že se na lodi nachází lokačními zařízení udávající jejich polohu do vesmíru. Současně se Rush a Wrayová obávají o soudnost plukovníka Younga a chtějí zařídit civilní dohled nad celou operací na palubě Destiny.
Rush rájön, hogy a lerázottnak hitt nakai hajóhad nyomon követi a Végzetet, és hamarosan megtalálnak egy, a Végzethez tapadó nakai kompot. Young és Scott eltávolítják, ám közben gyanús jelek mutatkoznak...