In the late 22nd century, an alien race known as the Gamilons have attacked the Earth, bombarding it with radioactive bombs and forcing the population underground. However, the radiation is seeping into the planet; unless it's removed, Earth will become uninhabitable in one year. War with the Gamilons has also destroyed the Earth's space forces except for two ships -- the Paladin, commanded by Alex Wildstar, and another ship, commanded by Captain Avatar. During a battle at Pluto, Avatar's ship is damaged. The Paladin gives Avatar's ship enough time to escape, but is destroyed in the process.
Meanwhile, a non-Gamilon alien ship is hit in the crossfire and crashes on Mars. Cadets Derek Wildstar, Alex's younger brother, and Mark Venture investigate and discover a beautiful, dead woman, ejected from the escape pod and clutching a message capsule. They return to Earth in Avatar's battleship, and Derek notices the absence of any other ships. On the way back, they learn of Alex's fate. After they return, Derek confronts Avatar about Alex, but Avatar says it was Alex's decision to remain.
When the message capsule is decoded, it contains a message from Queen Starsha of planet Iscandar. Starsha says the messenger was her sister, Astra, and offers Earth the Cosmo DNA, a device which can remove the radioactivity. The message also contains plans for an advanced-technology Wave Motion Engine -- capable of faster-than-light travel. As the Earth Defence Command deliberates, a Gamilon recon plane is detected sniffing around the ruins of the sunken WWII battleship, the Yamato. Out of sheer boredom, Wildstar and Venture take a plane out (unauthorised) to investigate. The Yamato appears to be nothing more than a hunk of ruins, however, leaving the cadets puzzled as to why Gamilon would be interested in it.
Anno 2199. Su Plutone le forze di difesa della Terra si trovano a sostenere una battaglia impari con un nemico sconoscuto, la flotta di Gamilon. Mentre il Capitano Avatar e' impegnato in una ennesima battaglia contro gli invasori, su Marte i cadetti Mark Venture e Derek Wildstar vengono inviati in missione di ricognizione; devono infatti investigare su un oggetto sconosciuto che si e' appena schiantato sulla superficie del pianeta rosso. I due scoprono che l'oggetto non era altro che una piccola navicella spaziale guidata da una graziosa donna di nome Astra, morta nell'impatto. Mark e Derek rinvengono un messaggio racchiuso in una capsula e lo portano alla base. Nel frattempo su Plutone la flotta terrestre viene decimata da Gamilon. Solo la nave comandata da Avatar e quella di Alex Wildstar, fratello di Derek, riescono a tenere testa ai nemici ma alla fine Avatar ferito e' costretto a comandare il ritiro delle due navi. Wildstar si rifiuta di obbedire e scaglia un ultimo disperato attacco contro la flotta Gamilonese ma la sua nave viene distrutta. Avatar ritorna cosi' su Marte dove ad attenderlo c'e' Derek che si dispera per la morte del fratello, ritenendone responsabile il vecchio comandante. Intanto l'astronave fa rotta verso la Terra. Il pianeta azzurro è devastato dalle radiazioni a seguito dell'attacco con asteroidi radioattivi, e gli abitanti si sono rifugiati entro città sotterranee. Ma la radioattività crescente inizia a penetrare anche nel sottosuolo ed entro un anno raggiungerà gli abitanti. Quì Derek incontra Nova, il Dottor Sane e il robot IQ-9 che si prodiga nell'analisi del messaggio recuperato dalla navicella di Astra. Il messaggio contiene alcuni piani per la costruzione di un potente motore ad Onde Moventi e una mappa per raggiungere Iscandar, un pianeta lontanissimo i cui abitanti offrono ai terrestri il CosmoDNA, un congegno capace di guarire la Terra dalle radiazioni mortali sviluppatisi in seguito al conflitto contro Gamilon.
Una navicell