「ケロロ ニョロロ滅亡？ であります」ニョロロから逃げようと超空間ゲートに逃げ込んだケロロ小隊。だが、彼らは偶然出来たワームホールに入ってしまい…。 「ラビー お嫁に行きます！ であります」空き地にいたラビーを見かけた556。そこで、556はラビーが結婚を申し込まれているのを目撃してしまう！
雨季到來，Nyororo們對秘密基地發起了進攻。抵抗中，keroro打開了通往百億年前宇宙的蟲洞。他們於是準備回到過去，抹殺Nyororo們的存在。 夏美和小雪在上學途中目睹了驚人一幕！拉比要結婚了！但是556死也不同意這門親事，Keroro小隊能幫到拉比嗎？
