Treni e navi scompaiono in tutto il mondo. Contemporaneamente, il dottor Yamatone viene incaricato dal quartier generale dell'Alleanza Internazionale di sorvegliare un magazzino in cui sono conservate bombe atomiche e all'idrogeno in tutto il mondo. Il motivo è che qualcuno ha rubato una mappa che mostra la loro posizione. Il colpevole è in realtà Nazo, che vuole sradicare i magazzini di bombe H usando il Galgar, un uccello mostruoso che emette raggi antigravitazionali dagli occhi. L'incidente precedente era solo un test per questo scopo!
Trains and ships disappear all over the world. At the same time, Dr. Yamatone is assigned by the International Alliance headquarters to guard a warehouse where atomic and hydrogen bombs are stored around the world. The reason is that someone stole a map showing their location. The culprit is actually Nazo, who wants to eradicate the H-bomb warehouses using the Galgar, a monstrous bird that emits anti-gravity rays from its eyes. The previous incident was just a test for this purpose!