Sarah se přihlásí v Dyadu v naději, že tím ochrání Kiru, ale je zajata, stejně jako Duncan. Duncan spáchá sebevraždu, aby Rachel nezískala to, co potřebuje. Kira mezitím tajně kontaktuje Cala, který se spojí s paní S., aby společně naplánovali záchranu Sary a Kiry. Scott a Cosima mezitím pomáhají Saře utéct. Helena se konečně seznamuje s Alison a Cosimou. Sarah se dozvídá o projektu Castor, který je mužskou verzí projektu Leda. Všechny klony vypadají jako Mark.
Mit einem Trick bringt Rachel Sarah dazu zu kapitulieren. Da tut sich der Klon-Club zusammen, um Sarah mit vereinten Kräften und einem cleveren Schachzug zu retten. Während Sarah die Flucht aus Rachels Klauen gelingt, findet sie eine mächtige Verbündete, die ihr eine neue erschütternde Dimension des Klon-Experiments offenbart.
The war with Dyad is all but lost when Rachel’s latest ploy forces a broken Sarah to concede. The Clone Club springs into action, uniting in a reckless gambit to save Sarah. As they fight to gain their freedom, Sarah encounters a new ally and uncovers a terrifying new dimension to the conspiracy.
Helena est enlevée, le club des clones s'unit pour venir en aide à Sarah et Marion fait des révélations fracassantes sur le programme.
בפרק סיום העונה; שרה מסגירה עצמה ל-"דיאדה" כדי להציל את קירה, אך אז מתברר שלרייצ'ל היו תוכניות שונות משהצהירה עליהן. שיבון ופליקס מנסים לחלץ את שרה וקירה מ-"דיאדה". מצבה של קסימה מחמיר.
Mentre Helena viene rapita da due sconosciuti, il Clone Club studia come liberare Sarah. Intanto Marion rivela verità sconvolgenti sul programma di clonazione.
A guerra contra a Dyad parece perdida quando o último plano de Rachel força Sarah a perder. O clube dos clones entra em ação, unindo-se numa tentativa desesperada de salvar Sarah. Enquanto luta para conquistar a sua liberdade, Sarah depara-se com um novo aliado e descobre uma assustadora nova dimensão da conspiração.
Sarah se entrega al Instituto Dyad en un intento desesperado de proteger a Kira. Cosima, Scott y Kira preparan un plan para ayudar a Sarah a escapar. Marion revela que el proyecto Leda es solo una ramificación pequeña de un ambicioso plan desarrollado por los militares.