傷が悪化して破傷風にかかり、意識不明の暁生（窪塚洋介）。そんな最中、本倉高校を突然竜巻が通り過ぎる。決死の旅の末、結花（常盤貴子）たちは薬を手にして学校に戻って来るが、暁生は呼吸困難に陥っていて窒息死の危機。このままでは死んでしまうと結花は手術を決断する。医学部進学を目指していた柳瀬（鳥居紀彦）のオペが始まる。大切な暁生を失うまいと必死に補助する結花。激痛に耐える暁生。 大友（山下智久）は高松（山田孝之）たちを探して学校の裏に行くと、畑を守って竜巻に襲われた池垣（松本伸夫）が倒れていた。ついにこらえきれなくなった生徒達はダイナマイトで人工的に地震を起こし、時空を越えて元の世界に戻ろうと考える。もう水も食料も尽きつつあったのだ。 一方、本倉高校跡地では、産廃業者たちが学校が無くなって出来た巨大な穴になんとゴミを捨て始めた。そこに、それを阻止しようとして抵抗する藤沢（妻夫木聡）とかおる（水川あさみ）の姿があった。