In der Schlacht von Hakodate, in der sein ehemaliger Meister Toshizou Hijikata sterben würde, trifft Izuminokami auf Horikawa, der jetzt das Emblem des Shinsengumi trägt. Als Izuminokami sich nach einem Aufeinandertreffen von Idealen entscheidet, begibt er sich nach Ippongi Kanmon, um die Time Retrograde Army mit Mutsunokami und dem Rest seiner Kameraden zu stoppen. Die Schwertkrieger der ersten und zweiten Einheit nehmen ihre Mission zum Schutz der Geschichte wahr und treten gegen die tausend Truppen der rückläufigen Armee an.
At the Battle of Hakodate, where his former master Toshizou Hijikata would die, Izuminokami runs into Horikawa who is now wearing the emblem of the Shinsengumi. As Izuminokami makes up his mind after a clash of ideals, he heads to Ippongi Kanmon to stop Time Retrograde Army with Mutsunokami and the rest of his comrades. Embracing their mission to protect history, the Sword Warriors of First Unit and Second Unit face off the one thousand Time Retrograde Army troops.
Kunihiro y Kane-san se reencuentran tras su marcha y se ponen al día de lo ocurrido en los últimos años. Kunihiro sigue sin saber qué hacer realmente con la muerte de Hijikata-san, pero ambos encontrarán su respuesta.
La conclusione della battaglia di Hakodate e il destino di Hijikata Toshizou si avvicinano. Kunihiro sarà stato in grado di dimostrare la sua lealtà? Izuminokami sarà in grado di proteggere la storia?