Alla fortezza si studia una strategia difensiva per affrontare la nuova base nemica. L'impero di Mikenes nel frattempo attacca sfruttando tre mostri: il primo allontana Venus dalla base mentre gli altri due bloccano il Grande Mazinga, mettendolo seriamente in difficoltà.
Junior robot e Boss intervengono in aiuto di Venus e miracolosamente il meostro viene distrutto da Boss che accorre in aiuto di Mazinga, permettendo a Tetsuya di tornare alla Fortezza delle scienze, per far riparare il robot e ricevere le cure del caso.
Nel frattempo Demonica assalta la Fortezza di Kabuto, mentre Tetsuya è in rianimazione e Boss e Shiro sono stati catturati.
「僕には他の子みたいな楽しい日曜日なんかないんだ!」(シロー) 自らの地位を危ぶむアルゴス長官は、ヤヌス侯爵と組んで起死回生の作戦を開始した。戦闘獣・ドメスを差し向けてビューナスAを攻撃。グレートマジンガーにはルバンバとグロッサーを同時に当たらせて追いつめてゆく。助太刀に来たボスボロットとロボットジュニアも、デモニカを指揮する地獄大元帥に捕らわれてしまう。