Los Digimon se enfrentan a Meicoomon, que ahora tiene más poder que antes. Los mundos están en juego, pero también las relaciones con sus amigos.
Koshiro descobre o que está causando a infecção. Enquanto isso, Meicoomon aparece na cidade e os Digimon partem para impedí-lo. A reinicialização do Digimundo é iminente, mas Koshiro tem um plano.