錬金アカデミー、そしてミナトという大きな存在を失った宝太郎たち。 自分の進路を見失い途方に暮れる宝太郎。 錬金術師の道を諦めようとする蓮華。 そしてそれを止められない錆丸。 それぞれが葛藤する中、再びムーンマルガムの魔の手が・・・ しかし、今の宝太郎の力ではどうしてもマルガムは倒せない。 再び現れたオレンジ色のガッチャードの教えを受け、 自分の力でマルガムを倒す術を見つけ出す決意をした宝太郎は、なんと過去にタイムリープ！？ タイムリープの裏には、ある秘密が隠されていた。 果たして、 宝太郎はマルガムを倒し、 自分の進路を再びガッチャできるのか！？
Alchemy Academy and Houtarou and his friends have lost the important figure of Minato. Houtarou loses his path and is at a loss. Renge tries to give up on becoming an alchemist. And Sabimaru can't stop it. While each of them is in conflict, Moon Margam's evil hand is once again... However, with Houtarou's current strength, Margam cannot be defeated. Receiving the teachings of the orange Gatchard who reappeared, Houtarou decides to find a way to defeat Malgam with his own power, and is time-leap into the past! ? A secret was hidden behind the time leap. Will Houtarou be able to defeat Malgam and get back on his path? ?
