Lorsqu'un meurtre est commis dans le village où l'Instit vient travailler, l'étranger du village est aussitôt pris en cible.
Victor Novak commence son premier jour de cour avec sa classe de CM2 quand un petit garçon entre dans la classe en chaise roulante. Le petit Thomas a perdu l'usage de ses jambes après un accident de voiture l'année précédente. Aigri, il s'en prend à la terre entière et a perdu le goût de vivre. Il est élevé seul par sa mère, Christine qui lutte pour que son fils ait une scolarité normale. Victor doit faire preuve de tendresse et d'intelligence pour se faire apprécier de l'enfant.
Nommé sur un port de Pêche sur la côte Atlantique, Victor Novak trouve son attention attirée par un jeune garçon de dix ans, Guillaume Serrelec. Malgré le fait que Victor essaye par tous les moyens de gagner sa confiance, l'enfant défie sans cesse la mort en arpentant la pointe des falaises. Même Georges Hargrove, son professeur de violon qui s'apprête à lui faire jouer en public le concerto inachevé composé par sa maman, désespère d'en tirer quelque chose. Son comportement s'explique, selon la directrice de l'école, par la disparition de sa mère, Odile, violoniste célèbre quelques années auparavant. Pourtant, son père, Loïc Serrelec, a tenté de recomposer un cadre familial normal en épousant sa collaboratrice, Eliane, elle-même mère d'un petit garçon, Florent, sept ans. Seuls Irène son amie et sa confidente, Eliane et Florent connaissent le lourd secret que Guillaume protège : son père le bat. Novak finit par découvrir ce secret et tente patiemment de démêler les liens de haine et d'amour qui unissent le père et le fils.
En enseignant dans un village de Haute-Savoie, Victor Novak remarque que sa classe est divisée entre les élèves dont les parents travaillent et ceux dont le père ou la mère est au chômage. Le petit Matthieu est dans ce dernier cas. Sans emploi, sa mère, Maria, ne peut lui payer la cantine et les cours de karaté. Cette dernière mendie puis commence à voler. Matthieu apprend vite la vérité de la bouche d'un camarade, et ce, devant toute la classe. Victor Novak doit rapidement régler le problème.
Un père de retour d'Afrique après dix ans d'absence veut reprendre sa place auprès de sa fille, mais les grands-parents s'y opposent.
Affecté dans une section d'éducation spécialisée, Victor Novak se rend compte que certains de ses élèves sont violents et n'accordent aucun intérêt aux cours. Leur renoncement manifeste les mène tout droit à l'échec. Certains sont même surpris en train de dormir en classe. C'est le cas de Vanessa, qui attend d'avoir 16 ans, fin légale de la scolarité obligatoire, pour quitter l'école. Elle travaille le soir dans le restaurant de son père et, épuisée, somnole toute la journée. Novak est bien décidé à changer tout cela et à extraire l'adolescente de sa torpeur...
Willy, un enfant qui s'entend mal avec son père, fugue avec la complicité de Samson, un simple d'esprit. Sa disparition et la découverte d'une veste tachée de sang déclenche une montée de haine contre Samson.
Victor Novak emmène sa classe faire un séjour en Auvergne dans une vieille ferme, chez Isabelle, Daniel, et leur fille, Clémence. Il y a aussi Valentin, le père d'Isabelle, qui a été incarcéré durant quinze années pour un crime qu'il assure n'avoir pas commis. Alors que les enfants commencent à s'imprégner de la campagne, un nouveau meurtre est commis.
Dans la tête d'Alain, un mot revient sans cesse, plus harcelant qu'un bourdonnement d'insecte : sida... suivi d'un autre mot : papa... Alain n'en peut plus de ce secret si lourd. Il se confie à Victor Novak. Et il a raison, car personne d'autre n'est mieux à même de lutter contre les fausses idées qui circulent sur le sida, à Hyères et ailleurs...
Des lettres anonymes dénoncent l'attitude des villageois juste après la guerre. Un homme avait été dénoncé comme collaborateur sans procès. Tandis que le village où l'Instit vient effectuer un remplacement se prépare à célébrer le 8 Mai 1945, Victor Novak est surpris du manque de connaissance de sa classe sur le sujet. Il décide d'organiser un exposition sur la guerre, tandis que le corbeau continue ses lettres anonymes. Il semble qu'une guerre fasse également rage à l'échelle politique pour déterminer le nouveau maire en vue des prochaines élections.
Rémi et Noémie, 10 ans, sans être frère et sœur, ont été placés dans la même famille d'accueil. Ils passent leur temps à guetter chaque passager qui débarque du bac reliant la ville de Quillebeuf-sur-Seine à la zone industrielle dans le secret espoir de reconnaître leurs mères respectives. Dans leur classe, il y a deux clans, d'un côté les Rupins : ceux de la vieille ville, de l'autre les Zupins élevés dans le béton.
Victor est envoyé dans une école élémentaire de Montréal au Québec suite à un échange d'enseignant entre la France et le Canada. Deux semaines après son arrivée, un nouvel élève, Yohan Lafontaine, rejoint l'effectif en cours d'année. Ce dernier a des réactions imprévisibles, a l'humeur changeante, et éprouve de grandes difficultés à se lier d'amitié avec les autres élèves de sa classe, ses nouveaux camarades ne l'acceptant pas. Le père de Yohan, à qui on a volé son portefeuille avec ses papiers et le reste de son argent, ne peut plus payer l'hôtel et se retrouve à la rue avec son fils. Intrigué par l'enfant, l'Instit s'efforce de nouer avec lui des rapports confiants afin de découvrir ce que l'enfant cherche à lui cacher. Yohan et son père Patrick sont en fait sans domicile fixe...
Parmi les nouveaux élèves de Victor, se trouve Charlotte, 10 ans, vive et malicieuse, qui vit seule avec sa mère. Elle est persuadée que son père disparu n'était pas son père biologique. Elle tente d'en savoir plus auprès de sa mère, qui se montre évasive et refuse de répondre.
Victor Novak arrive dans la région du lac Léman, où il prend en charge six enfants au sein d'un hôpital. Parmi eux, Martin, renversé par une voiture et qui est resté dans le coma pendant deux semaines. A son réveil, il avait oublié ce qui s'était passé juste avant son accident
Clara, 10 ans, est épanouie, heureuse en famille et à l'école. Mais tout s'effondre le jour où l'instit lui annonce le décès de sa mère dans un accident de moto. La veille de sa mort, Catherine avait tenté d'aider Magali, une jeune délinquante enceinte, parce qu'elle se revoyait en elle quelques années plus tôt. Clara décide d'aider la jeune fille.
Pablo, un petit gitan, a le béguin pour Cécile mais celle-ci est toujours sur la défensive et semble avoir un secret trop lourd à porter. L'ancienne institutrice a démissionné et refuse de rencontrer Novak qui la remplace. Quant au père de Cécile, il semble un peu trop doux avec sa fille...
Cinq élèves influencés par la bande dessinée "Frères de sang" ont fondé la tribu des Chiricahuas. Jérôme et Thomas ont échangé leur sang. Le père de Thomas et la mère de Jérôme ont décidé de vivre ensemble. Thomas n'ayant pas respecté leur serment de n'avoir aucun secret l'un pour l'autre, Jérôme l'oblige à subir des épreuves très dures.
Le père de Julien pousse son fils pour qu'il soit premier. Le père de Moussa, lui, doit retourner dans son pays. Julien et Moussa sont tous deux bons coureurs et un enfant sélectionné pour ses performances sportives aura la possibilité de suivre de bonnes études. Moussa est ami avec Marco et Danka, un garçon et une fille qui s'aiment, bien que d'origines différentes...
Deux jumelles, Marie et Claire, considèrent qu'elles ne font qu'une et veulent qu'on les appelle Marie-Claire. Louis, amoureux d'une des deux vient semer le trouble...
Fred, 10 ans, retrouve sa mère Charlotte qui est en liberté conditionnelle. Ils vont vers Saint-Michel où Fred a hérité d'une moitié de la ferme de son grand-père. L'autre moitié a été léguée à Jérémie, son cousin qui ignore jusqu'à son existence. Charlotte projette d'ouvrir un centre de réinsertion pour les ex-taulards. Mais la mère de Jérémie lui voue une haine féroce.
Les effectifs de deux écoles de villages voisins étant trop faibles, un regroupement scolaire est prévu afin de sauver au moins une des deux écoles. Mais aucun n'accepte de voir sacrifier son établissement. Ders deux frères dans la même classe, un semble pourtant se réjouir à cette idée.
Le père d'Aymeric faisait vivre autrefois le village en faisant travailler les habitants dans son usine. Mais il est maintenant ruiné et sans emploi, sans que personne ne soit au courant de sa situation. Il essaie de maintenir son rang social, mais Aymeric découvre bientôt la vérité.
Éric et Kellian vivent avec leur père. Celui-ci est séparé de leur mère et vit maintenant avec un homme. Lorsque son homosexualité est révélée, les enfants subissent les quolibets de leurs camarades.
En Martinique, une enfant est empêchée de participer à une commémoration sur l'esclavage. Son grand frère préfère en effet dénoncer la misère qui continue à régner dans l'île. Mais elle est amie avec le fils d'un riche propriétaire qui est aussi le patron de sa sœur.
Yann et Ludovic sont copains de classe mais mauvais élèves. Le père de Yann est ingénieur et pourtant au chômage. Celui de Ludo, sans diplôme, est patron de magasin. Les enfants ne voient pas l'intérêt de travailler, et avec un ado en échec scolaire qui squatte un grenier, ils vont faire quelques bêtises...
Cédric est un garçon doué et studieux, qui aime la musique classique et joue particulièrement bien du piano. Mais il est le souffre-douleur de ses camarades de classe et peine à s'intégrer au près d'eux. Après un dernier échec pour essayer de se faire d'un de ses copains de classe un ami, il fait une tentative de suicide...
Un nouvel élève, David, arrive. Son père est l'amour de jeunesse de l'infirmière de l'école. Le fils de l'infirmière, Sébastien, et David sont dans la même classe. Sébastien et sa mère ont une relation exclusive et elle ne pardonne pas au père de David de l'avoir quittée sans prévenir.
Dorian, est un jeune garçon, bien élevé et mature. Mais derrière le beau visage du garçonnet, se cache un très lourd secret. Dorian, a en effet un grand frère, Camille 12 ans, sortit tout juste de l’hôpital psychiatrique. L'adolescent autiste sévère, n'est pas aimé par son père, qui veut absolument cacher son fils de tout le monde. Victor Novak se mobilise en essayant de rapprocher père et fils, malgré le handicap.
Un cirque s'installe dans le village où Victor Novak effectue un remplacement. Théo, 9 ans, est fils d'un forain, mais sa mère s'est établie dans le village après son divorce et elle veut qu'il vienne vivre avec elle pour suive une scolarité normale. Théo préférerait rester avec les gens du cirque, notamment pour aider son père aux manèges.
Les parents de Marine sont endettés et risquent de perdre leur maison. Marine se rapproche alors de Fabien, un nouvel élève qui vit avec son père dans une caravane au camping.
Le père de Ting-Ting, une fille de la classe de Novak, travaille au noir mais se blesse. La famille ne peut plus payer le loyer et risque en outre l'expulsion du territoire. D'un autre coté, Baptiste se fait racketter par une bande de jeunes mais ne dit rien à sa mère.
Steph, garçon manqué et enfant difficile, sème le trouble dans la classe de CM2. Sa jeune institutrice, poussée à bout, finit par la gifler. Un peu plus tard, elle fait une chute de cheval à cause de Steph. Novak fait le remplacement et remarque rapidement la jeune fille. Arrive aussi un nouvel élève, Raphi, dont le grand frère est dépendant à la drogue.
Dans une région viticole, Mathieu est choisi pour être "l'ange des vignes" pour le défilé de cette année. Ses parents découvrent, à la suite d'un malaise, qu'il a une tumeur au cerveau. Ils cachent la vérité à tout le monde, mais bientôt des rumeurs circulent.
Novak se rend à Madagascar voir un ancien ami avec Arthur,12 ans, pour que celui-ci rencontre son père qu'il n'a pas vu depuis plusieurs années. L'homme travaille pour une ONG à Madagascar mais les difficultés engendrées par les manques de moyens financiers et par les traditions ne manquent pas.
Jean-Claude Paulin, qui n'a pas réussi à devenir un sportif de haut niveau à cause d'un accident, met tous ses espoirs dans sa fille Manon, passionnée de tennis. Les entraîneurs s'accordent pour reconnaître qu'elle ne sera pas une grande championne mais son père la pousse dans cette voie au péril de sa santé.
La mère de Morgane cache à tout le monde que son mari s'est pendu il y a plusieurs années. Morgane, pensant que son père est mort dans un accident mais sentant qu'on lui cache quelque chose, fait appel à une amie plus âgée pour connaître la vérité grâce aux tarots.
Petite fille très vivante et ouverte au monde, Aurélie, âgée de 9 ans, est une petite passionnée de la nature et des bêtes. Malgré sa joie de vivre et son énergie de folie, se cache une enfant souffrante d'hyperactivité que tout le monde ignore. Bêtises sur bêtises, la directrice de l'école ne peut autre que la renvoyer. Victor Novak se mobilise et va essayer de s’intéresser la fillette.
Dans la classe de l'instit, il y a Thomas, le fils du maire en alliance avec l'extrême droite, Laetitia, dont les parents connaissent des difficultés financières, et Mathieu, le fils de l'aubergiste qui ne veut pas que son fils fréquente le fils du maire. Les mesures prises par le maire mettent à mal l'amitié des trois enfants.
Victor Novak s'envole pour la Guyane en compagnie d'un groupe d'enfants de la DDASS, invités à assister au prochain décollage de la fusée Ariane. Un des enfants, Valentin, s'est mis en tête de retrouver la tombe de son arrière-grand-père. Il s'échappe et va seul voir les vestiges du bagne de Cayenne.
Dans un village, une vache a la maladie de Kreutzfeld-Jacob. Tom ne se résout pas à ce que l'élevage de son père soit abattu.
L'instit emmène un groupe d'enfants et quelques élèves de 5° en classe verte dans un gîte rural en Auvergne. Un des collégiens, Paulo, doué pour le violon, évite de jouer devant ses camarades. Ludovic, un des écoliers, le considère comme son grand frère.
L'instit va voir la façon dont on enseigne dans une petite école en Suisse. Une des élèves, Léa, vit avec sa grand-mère qui l'a élevée depuis la "disparition" de sa mère. Lorsque la vieille dame est hospitalisée, l'instit apprend par Julien, un copain de Léa, que la mère de celle-ci est en vie. Il la fait venir. Le père de Julien, lui, songe, à changer son fils d'école à cause des méthodes d'éducation.
Adrien danville, est un jeune garçon âgé de 11 ans. Nouveau dans la région et dans l'école, le jeune garçon a bien du mal à s'intégrer et à être accepté dans la classe. Pourtant, discret, gentil et très intelligent, se cache en effet un enfant atteint du syndrome d'asperger. Une forme d'autisme qui le rend incapable de communiquer et d'exprimer ses émotions autres qu'avec de la violence. Adrien ne supporte pas le bruit des chaises bougés par les élèves, qui le rend hypersensible et angoissé. L'instit apprend par les parents le handicap de leur fils qui n'arrivent plus à bien gérer et à contrôler. Notamment le père, qui renie son fils, et sa sœur qui a honte de lui. Victor Novak va tout faire pour réintégrer le petit, et redonner une confiance envers les parents et la grande sœur d'Adrien.
Un couple arrive au village mais ne veux pas envoyer son enfant à l'école. L'instit va essayer de convaincre les parents ainsi que l'enfant du bienfait de l'école et tenter de comprendre leurs raisons. Par ailleurs, il semble qu'un triangle amoureux ai lieu au sein de la classe. Victor Novak va devoir s'atteler à résoudre ce problème.
L'instit va en Tunisie et s'installe chez un couple franco-tunisien. Leur fils Gabriel est replié sur lui-même : né en France et arrivé récemment en Tunisie, il refuse la culture de son père. L'instit va lui faire découvrir le pays avec Zahia, 11 ans, et sa mère qu'il a rencontrées dans l'avion.
Alexa veut devenir star et ses tenues ne passent pas inaperçues à l'école. Elle suit des cours de danse et chant, encouragée par sa mère qui voit se réaliser son propre rêve, mais qui a des problèmes financiers. Alexa doit bientôt passer un casting.