Gli agenti al servizio del Ministro Ombra si intrufolano sulla Divina Libertà e ne prendono il comando, occupando i punti strategici della base. La nave viene fatta decollare verso lo spazio per essere fatta esplodere, sotto lo sguardo impotente del suo equipaggio. Nel frattempo la Terra viene assediata da un mostro sintetico che devasta le città. Takeru e Mai partono alla volta del Giappone coi rispettivi robot per affrontare il robot mentre il resto del team cerca disperatamente la bomba a tempo collocata dagli invasori. Grazie ad una traccia lasciata da Tensai, ostaggio del nemico, Hitoshi e Futoshi trovano la sala dove si trova l'ordigno che viene espulso in tempo. La nave torna sulla Terra dove Plyzer e Mighty sono in grossa difficoltà ma grazie ai componenti lanciati dalla Divina Libertà il Gackeen può prendere forma e sconfiggere il nemico.