Alexis, Hassleberry, Jaden, Jim und Syrus versuchen in das Testlabor von Viper einzudringen. Der hinterlistige Viper beobachtet währenddessen die Freunde und es gelingt ihm Alexis in eine Falle zu locken. Jaden sieht sich vor einer anderen Herausforderung stehen. Denn plötzlich taucht sein alter Lehrer Professor Stein auf und fordert ihn zu einem Duell heraus.
With most of the school, including Blair, in the infirmary, Jaden and his friends go and find Viper. While investigating Viper's complex, the gang ends up getting separated. Jaden duels against Professor Stein and his Scab Scar-Knight, which turns his Monsters against him.
Axel Brodie scopre dove si nasconde Viper ed entra per scoprire cosa stia tramando, ma cade in trappola. Intanto anche Jaden e gli altri raggiungono il nascondiglio.
デス・デュエルにより大量の負傷者が出たことで、プロフェッサー・コブラがその事件に関与していると確信した十代たちは、コブラが潜む研究施設SALに急行。ここでコブラを探す最中、十代は佐藤先生に出会う。
Mientras busca a Viper, Jaden encuentra a un ex maestro que tiene una prueba final para él.