Nachdem die Finsteren Auserwählten die besiegte Carly vor dem sicheren Tod bewahrt haben, wird Carly ein Teil dieser Gruppierung. Daraufhin kann, die voller Kraft strotzende Carly erneut Sayer in einem Duell gegenübertreten. Währenddessen beginnt ein weiteres Duell: Akiza muss sich der als eine Finstere Auserwählte offenbarte Misty stellen.
New Domino City is shaken by an earthquake as a new geoglyph is set ablaze. To Sayer’s surprise, somebody shows in his office: Carly, alive… and as a Dark Signer. She challenges Sayer to a Shadow Duel for revenge, and Sayer is shocked by her new monsters’ abilities. Noticing the geoglyphs, Jack heads towards the action, almost being engulfed by the flames in the process. Meanwhile, Akiza is approached by Misty, who challenges her to a duel, as a dark signer as well.
Carly Carmin, qui a été projetée du building du Mouvement Arcadie après son duel contre Sawyer, causant sa mort après son duel avec Sawer, revient à la vie en tant que Pactisante des Ténèbres, et défie Sawyer (Divine) en duel. Pendant ce temps, Misty Trudwel, après avoir ressenti que Carly est devenue une vraie Pactisante des Ténèbres, va au Mouvement Arcadie pour affronter Akiza Izinski. Afin de se venger, elle aussi.
資料を調べていたカーリーは、その中にミスティの名前を見つける。早速、ミスティに会いに行くカーリー。しかし、弟をアキに殺された、というミスティはアルカディアムーブメントには近付くな、とカーリーに忠告する。しかし、カーリーはその忠告を無視し、アルカディアムーブメントに潜入する。呆気なくディヴァインに見つけられ、デュエルを仕掛けられ、敗北するカーリー。だが、D・カーリーとなって復活し、ディヴァインに闇のデュエルを挑むのであった。今度は逆に、D・カーリーの熾烈なデュエルにディヴァインが苦戦する。
