ベム（亀梨和也）・ベラ（杏）・ベロ（鈴木 福）は緒方家でベムが持っている新聞記事の写真と 同じ男が写った写真を緒方教授（あがた森魚）に見せられる。 一方、街では篠山豊（斎藤工）が警察官を次々と襲っていた。 夏目刑事（北村一輝）はその連続警察官暴行事件の捜査をしながらも、一度見てしまったベムたちの妖怪姿が 脳裏から焼きついて離れなかった。 そんな中、ベムたちは緒方家から出てきた古びた手紙によって 自分たちが生まれた場所とも考えられる研究所の場所を知るが・・・
