星団連邦への叛乱の嫌疑も晴れ、ついに第二ミルチアに到着するクーカイ・ファウンデーション。だが、アルベドがネピリムの歌声を使用したことにより、グノーシスの大群が出現する。市街地に潜入してきたグノーシスを迎え撃つシオンたち。そんな中、エイグスで出撃したバージルは、嫌悪していたレアリエンであるはずのモモを救ってしまう。バージル。しかし、ＫＯＳ─ＭＯＳの攻撃が、突破口を開こうとするバージルの命を奪ってしまう。
