Whistle! is about a boy named Shō Kazamatsuri. He transfers from Musashinomori School to Sakura Josui Junior High School for better hopes to make the soccer team, since he never got a game at his old school due to his small stature. Yūko Katori, his teacher, introduces him as a former star of the famed Musashinomori team, causing his classmates to be wrongly ecstatic. Right after that, one of the players, Tatsuya Mizuno, reveals that he was never a regular. In other words, since he never got the chance to play, Shō is a poor player. Shō struggles to improve his skill so he can make the team at his new school and to ignore the drastic disadvantage he has due to his height.
Shô Kazamatsuri est un garçon qui aime le football plus que tout. Cela est probablement dû au fait que dès sa naissance, on voulait faire de lui un joueur de football. En effet, son père veut faire de lui une grande star de la J-League (1ère division de football japonaise)... Shô a maintenant 13 ans, il vit seul avec son plus vieux frère et il a été admis dans l'école de football, Musashi-no-Mori. Toutefois, il a bien du mal à s'y imposer à cause de sa petite taille et décide donc de changer d'école afin de pouvoir faire ses preuves...
Shō Kazamatsuri è un ragazzo col sogno di diventare un calciatore professionista. Per fare ciò vorrebbe far parte della prima squadra della sua scuola, la "Musashi no Mori", ma non ci riesce perchè ritenuto troppo basso. Quando però si iscrive alla scuola "Sakura Jousui" riesce a farsi valere, avvicinandosi sempre di più alla realizzazione del suo sogno.
La historia trata, sobre Shô Kazamatsuri un chico apasionado por el deporte rey que quiere convertirse en el mejor jugador de fútbol que haya existido, aunque para su contra tiene muy poco talento, además de una pequeña estatura.
Shou Kazamatsuri wechselt zum 2. Jahr der Junior High von der Musashinomori-Schule, die die regional stärkste Schulfußballmannschaft besitzt, zur Sakurai Jousui-Schule, da er bei Musashinomori auf der dritten Ersatzbank war und trotz unermüdlichen harten Einsatz nicht mehr als Fußballgrundlagen, Konditionstraining oder Reinigung von Bällen und Fußballschuhen machen konnte. Außerdem erkannte er, dass seine Senpais in der Fußballmannschaft ihn, nicht zuletzt wegen seiner geringen Körpergröße von 146 cm, weder ernst nahmen als Fußballspieler, noch irgendwelche Zukunft als Spieler bei Musashinomori einräumten. Shou erhofft sich vom Schulwechsel endlich richtig Fußball spielen zu können und seine Freude am Fußball entfalten zu können.
怀有足球梦想的主人公风祭将，本来考上了足球名校—武藏森学园并进入了足球社，不过因为身高问题一直待在三军，后来由于不甘心不能成为正式球员，就毅然决然的转学到樱上水中学，但是转过去后发觉学校足球社并不强大，而后又因为误会而被社上学长们排挤，此时社上足球顶尖的水野龙也伸出了援手，并以队长做赌注，用足球赛打败了学长们；在水野龙也成为足球社队长后，与风祭将展开了复兴足球社的计划，之后又遇到了佐藤成树、不破大地、小岛有希等朋友的加入与帮助，于是就此展开了一段友情与成长的故事。
