Nach der Zerstörung des Zugangs zum Warehouse 13, kann James MacPherson noch eine Gefangene befreien: Helena G. Wells. Zusammen mit ihr flieht er nach Europa. Pete und Myka nehmen die Verfolgung auf. Inzwischen enttarnt Mrs. Frederic den wahren Verräter und Claudia trifft auf ihren Bruder. Auch Artie ist schnell wieder auf den Beinen und macht sich daran, die Gründe für MacPhersons Handeln aufzudecken.
In the season two premiere, we pick up right where we left off. MacPherson has blown Artie to smithereens, and disappeared. Is Leena really a traitor? Where has Claudia gone? How will Pete, Myka and the Warehouse fare without Artie? What other havoc did MacPherson wreak when he was alone in the Warehouse? And is there yet a new villain on the horizon?
Mac Pherson a réussi à s'échapper de l'Entrepôt avec des artefacts de bronze. Pendant ce temps Pete et Myka se dirigent vers Londres afin de recueillir des indices sur le plan que prépare Mac Pherson.
Dopo i fatti dell'ultimo episodio della prima stagione, Pete e Myka sono addolorati per quanto accaduto ad Artie, ma ben presto avranno una felice sorpresa: Artie è vivo, poiché si è salvato dall'esplosione mediante l'utilizzo dell'artefatto "fenice", che permette di salvarsi da morte certa uccidendo però un'altra vita. In questo caso a farne le spese è stato l'autista della signora Frederic, che stava tornando al magazzino e rimane così vittima di un incidente stradale, non riportando gravi ferite. Pur non credendo che Claudia sia complice di MacPherson, i tre si mettono anche sulle loro tracce. Mentre Artie va a Ginevra, dove Claudia sta cercando di raggiungere il fratello, Pete e Myka scoprono che MacPherson ha fatto scappare dal magazzino anche il celebre scrittore H. G. Wells e seguono una pista che li conduce a Londra. Qui, scopriranno che lo scrittore in realtà è una donna che sta aiutando MacPherson ad introdursi in un nascondiglio segreto del magazzino. Pete e Myka quindi, dopo essersi ricongiunti con Artie, che nel frattempo ha recuperato Claudia e si è completamente convinto della sua innocenza, ritornano al magazzino. Qui trovano MacPherson e Wells, quest'ultima, dopo aver recuperato alcuni oggetti personali, provoca la morte di MacPherson togliendoli il dispositivo che lo proteggeva all'interno del magazzino, per poi fuggire tramite un artefatto che la rende superveloce. MacPherson si ridurrà quindi in cenere proprio tra le braccia di Artie, e in punto di morte sembra mostrare segni di pentimento. Intanto la signora Frederic, uscita dall'ospedale, scopre che era stata Leena ad aiutare MacPherson, ma non l'aveva fatto per sua volontà, poiché era stata costretta tramite l'utilizzo di un artefatto denominato "perla".
In de eerste aflevering van het tweede seizoen gaan we precies verder waar we gebleven waren. MacPherson heeft Artie aan gort geblazen, en verdween. Is Leena echt een verrader? Waar is Claudia heen verdwenen? Hoe zal het Pete Myka en het Warehouse vergaan zonder Artie? Welke andere ravage heeft MacPherson aangericht toen hij alleen in het Warehouse was? En zit er nog een andere slechterik aan te komen?
MacPherson ratuje kolejnego więźnia z brązowego sektora i udaje się do Europy, by kontynuować swój plan. Pete i Myka identyfikują zaginionego więźnia.
В то время как Пит с Микой пытаются отыскать все, что осталось от их босса, МакФерсон, не без посторонней помощи, заполучает из хранилища весьма ценный артефакт и растворяется в неизвестности. Тем временем Арти спасает свою жизнь, при этом едва не погубив одного из своих приближенных, Клаудия пытается предупредить брата о грозящей ему опасности, а Латимер с Беринг отправляются в Лондон для поиска зацепок к местонахождению Джеймса и объекта, который он похитил.
MacPherson libera a H. G. Wells y escapa del Almacén con la ayuda de Leena (contralada mentalmente). Los agentes les siguen la pista para traerles de vuelta al Almacén.
MacPherson uteče i s tím, co vzal z bronzového sektoru Skladiště. Kvůli autonehodě musí paní Fredericová do nemocnice. Mezitím Pete a Myka míří do Londýna, aby nashromáždili nějaké informace o MacPhersonově plánu.
Artie szerencsésen túléli a robbanást, miután MacPherson egy újabb rabot szöktet meg a 'Bronz Szektor'-ból, és Európába utazik, hogy folytassa terve megvalósítását. Pete és Myka felfedik a szökött fegyenc személyét, aki nem más, mint H. G. Wells. Mindeközben, Mrs. Frederic-nek sikerül beazonosítania az igazi árulót és Claudia egy rövid időre újra találkozik a bátyjával.
