トンネル工事中に発見された巨大な洞窟。調査に向かう万城目と由利子の前に、古代怪獣ゴメスが現れた。ゴメスとリトラ、2大怪獣の壮絶な戦いを描く記念碑的第一話。
伊豆淡島に現れた巨人な猿ゴロー。そのゴローに愛情をそそぐ孤独な青年・五郎だが、巨大化したゴローのために盗みを働き…。ゴローそして五郎の運命や如何に…。
何者かによって送り返されてきた火星探査用ロケット。その中から発見された金色の小さな球体…。火星怪獣ナメゴンが、人々を恐怖に落とし入れる。
原因不明の地震が頻発し、地中から現れた巨大な植物の根が人々を襲う事件が起きた。そして、ビルを突き破ってマンモスフラワーが開花し、毒花粉を撒き散らし始める…。
南極基地へ向かう船に同乗した万城目。彼らを待ち受けていたのは、異常な寒波と怪現象だった。そして、3年前に失踪した隊員の手帳には「ペギラ」という不気味な文字が記されていた。
授業そっちのけでカメの飼育に夢中の太郎少年。夢は大きく育ったカメに竜宮城へ連れて行ってもらうことだ。ところがある日、強盗事件を起こしたギャングが、彼のカメを連れて逃げてしまう！
噴火の兆候を見せる富士山。しかし近隣住民の避難は一向に進まず、樹海の野生児タケルにも話が通じない。彼を探しに樹海へ入った由利子たちは、巨大な岩が飛び出すのを目撃する。
生物を巨人化させる物質ハニーゼリオン。その作用で巨大化したモグラが、近くの農村に現れた！管理ミスと思われていたこの事件は、嫉妬心が絡んだ複雑な人間ドラマの様相を呈していく…。
霧深い夜、とある灯台で巨大なクモが職員を襲う。一方、ドライブ途中で道に迷った万城目たちは、微かに見えた明かりを頼りに洋館を見つけるが、何とそこには伝説のクモ男爵の館だった…。
新東京駅より初運転を始めた地底超特急いなずま号。順調な試運転と見えたが、一平が間違えて人工生命体を持ち込んでしまう。制御不能となった地底特急の運命や如何に！
「燃料が無い」「風船」という通信を最後に墜落した土星ロケット、サタン1号。その後、万城目たちを襲う、突然燃料が切れるという怪現象。風船怪獣バルンガがあらゆる動力を吸収し無限に膨らんでいく…。
ある晩、動物園から動物が一頭残らずいなくなる事件が発生。「鳥を見た」と謎の言葉を残す飼育員。同じ頃、漁村に謎の船が漂着し、村の少年・三郎は船から飛んできた小鳥と交流を深めていく…。
熊谷ダム付近で発見された異常に軽い隕石。落下地点に調査へと向かった一の谷博士、万城目たちの前でダムに隕石が落下。湖水が一瞬にして蒸発し隕石怪獣ガラモンが現れた！
真夏のある日、羽田空港が氷付けとなる怪現象が発生！やがて、東京中へと広がる異常な寒波の原因を、万城目は南極で遭遇したペギラの仕業ではないかと推測する。
お金を集めることが大好きな金男少年。彼は振るとお金の音がする奇妙な繭に飲み込まれ、怪獣カネゴンになってしまった！元の姿に戻る為には工事現場のヒゲオヤジを逆立ちさせなければいけないらしい…。
天然物理学研究所から電子頭脳が盗まれた！その事件の背後に潜む怪しい男の影…。そして東京目がけて飛来する、無数のガラダマ…。隕石怪獣ガラモンが再び、人々を恐怖に落とし入れる。
「1/8計画第三次募集中」という看板を見つけた由利子。それは人口問題解決のため、人間や建物を1/8に縮小する計画だった。間違って縮小されてしまった由利子は、懸命に万城目たちのもとへ向かうが…。
不吉な出来事の前兆、さざめの竹の花。その花と、虹の卵が揃えば何でも願いが叶うらしい。少女ピー子はおばあちゃんの不自由な足を治すため仲間たちと虹の卵を探しに行くが、怪獣パゴスが近くに迫っていた！
相次ぐ人間消失事件。ある者は飛び込み台からジャンプした瞬間に、またある者は飲み物の入ったコップだけを残して…。偶然に事件を撮影した由利子は写真に不気味な液体が写っているのを発見する。
突如噴火した海底火山の近くにある岩根島で、漁師が網にかかった奇妙なものを持ち帰る。それは深海五千メートルに住む海底原人ラゴンの卵だった。卵を取り返すため、ラゴンは陸に上がり人々を襲い始める…！
ある夜、客船に乗っていた由利子は、床に落ちていた人形から「私はルパーツ星人。地球に怪獣が侵入した」という声を聞く。数日後、セスナで飛行中の万城目と一平が忽然と消え、機体だけが空港に戻ってくる事件が起こった。
山中で巨大な人間の足跡が発見され、雪男騒ぎが巻き起こる。由利子の友人、あや子は自分の婚約者・浩二が雪男だと打ち明ける。彼女によると、昆虫学者の浩二は日本にいないはずのモルフォ蝶の毒を浴びてしまい…。
漁船の第五太平洋丸がミクロネシア付近で消息を絶つ。この海域では他にも何隻もの船が行方不明になっているらしい。デスクから調査を依頼された万城目たちが付近の島に到着すると、彼らの目の前に巨大な蛸が上陸してきた！
アーブ国駐在大使の娘・瀬川タミが持っていたゴーガの像が、怪しい女性に奪われてしまった。像は盗品コレクターの手に渡り放射線鑑定を受けるが、その影響で像の中に眠っていた恐ろしい呪いが目覚めてしまう…！
深夜にかけて、自動車事故が頻発。被害者は一様に幽霊のような子どもの影を目撃し、更には懐中電灯や人形など必ず何かを紛失していた。現場近くにいた魔術団の少女・リリーのオルゴールには現場から無くなった小物が…。
人気ボクサーのダイナマイト・ジョー。彼の特徴は、自分の飼っているピーターという動物の予言通りに勝利を収めることだ。一見トカゲのようなピーターは水から出すと巨大化する性質を持っていて…。
超音波旅客機・206便を待ちわびている由利子。万城目と一平が研修から帰ってくるのだ。ところが、突如206便との連絡が途絶える。レーダーからも消えた206便だが、上空ではそのジェット音だけが不気味に響き渡っていた…。
誰でも一度は考えたことがあるだろう「現実からの逃避」。もし、この世の嫌なことから逃げ出して理想郷へ行くことができるのなら…。会社員の沢村は、気づくと空を走る電車に乗っていた。そこにはSF作家の友野という男が…。
