The Autobots on Cybertron evade capture and work toward finding a way to counteract the effects of the hypno-chips. Meanwhile, Optimus Prime leads the remaining Autobots in a battle to put an end to Megatron's plan.
Les Autobots réussissent à s'échapper, mais n'ont pas d'autre choix que d'abandonner Sparkplug derrière eux. Ils se cachent dans le laboratoire de Wheeljack, où ils commencent à construire un appareil qui libèrerait les esclaves du contrôle des techno-puces. Sur terre, Optimus Prime et les autres Autobots parviennent à la base productrice d'énergie de Mégatron alors même qu'ils s'apprètent à subir un raz-de-marée. Sur Cybertron, Wheeljack utilise son appareil pour libérer Sparkplug et tous retournent sur la Terre. Les Autobots suivent Mégatron sur son île-poste avancé tandis que les esclaves chargent son vaisseau spatial avec les nouveaux cubes d'Energon créés. Mégatron découvre au passage une fois de plus la duplicité de Starscream, qui essaie de mettre au point sa propre méthode de création d'Energon. Il échappe aux foudres de Mégatron grâce à l'attaque des Autobots. Wheeljack libère le reste des esclaves avec son appareil et les Autobots infligent une défaite aux Decepticans. Mégatron , poussé dans ses derniers retranchements, tente de s'échapper dans son vaiseau spatial, mais il est abbatu par les Autobots et l'Energon à bord explose, ce qui replace Cybertron dans son orbite initiale. Les Autobots se remettent de leurs émotions pendant que Mégatron flotte dans l'espace en attendant de se venger.
Los Autobots en Cybertron evitan la captura y trabajan para encontrar una manera de contrarrestar los efectos de los hipno-chips. Mientras tanto, Optimus Prime lidera a los Autobots restantes en una batalla para poner fin al plan de Megatron.
斯派克和其他人带着设计回到了千斤顶的工作室,千斤顶发明了一个高频率的装置。这个装置可以使控制晶片的电路系统发生故障。他们返回去救斯派克普拉并赶回家,另一方面汽车人一直都无法阻止霸天虎搜集能量块并把它们安放在一艘巨大的宇宙船上。这回他们开始了最后一战,千斤顶及时赶到并解放了人类奴隶兵,为汽车人的斗争清除了道路。
スパークプラグを追ってセイバートロン星にやってきたスパイクとサイバトロン戦士は、デストロンの基地で人間奴隷化の秘密を突き止めることに成功する。一方、滅亡の時が刻一刻と迫る地球で、コンボイは遂にデストロンに最終決戦を挑んだ。戦いの最中、メガトロンらは今まさに破滅を迎えんとしている地球から、大量のエネルゴンキューブを持って宇宙船で脱出しようとしていた。果たして地球とサイバトロンの運命はどうなってしまうのだろうか?
Сила притяжения Кибертрона грозит разорвать Землю на части. Между автоботами и десептиконами начинается решающая битва, от исхода которой зависит само существование нашей планеты. Под натиском автоботов десептиконы вынуждены отступить. Мегатрон, бросив своих подчинённых, с грузом награбленной энергии стартует с Земли на Кибертрон, но автоботы открывают огонь по его звездолёту. Энергокубы, находящиеся на его борту, взрываются, и мощнейшая ударная волна отбрасывает Кибертрон обратно в космос. Но Мегатрон уцелел и жаждет мести…