Kicker and Misha arrive in Jungle City, where helicopters come to complete the energon tower. But Alpha Q is not ready to let Earth go without a fight, and sends a group of stealth Terrorcons, named Command Ravage and Blackout. Unfortunately for him, both Kicker and Tidal Wave notice the Terrorcons, who are tunneling to avoid the base's defenses. In response, the Decepticons arrive via space bridge, and the energon mine and human allies are evacuated, but not before Misha requests that the pyramids near the city be protected.
古代遺跡のただ中に位置するジャングルシティに、突如、新しい種類のテラーコンが襲いかかる。それは、デストロンにテラーコンを奪われたアルファQが造りだした、新種のテラーコンによる隠密部隊だった。新たな敵の攻撃に加え、やがてデストロンも来襲。シティを死守するサイバトロンとの三つどもえの状況となる中、劣勢を強いられるグランドコンボイのとった行動は……。