Dünyanın en yetenekli okçusu olan Tozkoparan İskender, yüzlerce yıl önce Dünyamıza düşen bir göktaşına dokunma cesaretini gösterir ve özel güçler kazanır.
Gölge’nin ajanları, Ayasofya Camii’ndeki taşın yerini tespit etmeye çalışırken Tozkoparanlar da akademinin kütüphanesinde, Mete’nin görülerinden hareketle çizdiği sembolleri araştırarak Gölge’nin yerini tespit etmeye çalışırlar.
Gölge, Akademide gerçekleşecek öğrenci seçmeleri için engel olsa da başarılı olamaz, seçmeler gerçekleşir ve yeni öğrenciler Akademi’ye katılır. Pençe, Mavi Ay’dan iki kişi daha az olmasına rağmen Sinan'nın tutumu herkesi şaşırtır.
Akademiyi koruyan bariyerin devre dışı kaldığı ve Gölge tarafından manipüle edilmiş bir casus olduğu bilgisi herkesin birbirinden şüphe etmesine sebep olur.
İskenderin rüyasında gördüğü Osmanlı sancakları, Mete’nin semboller içeren görüleri sonrası, çözdükleri ipuçları ile birlikte Tozkoparanlar harekete geçer.
İskender ve Cenk arasında, İskenderin sancağı kurtarması yüzünden bir anlaşmazlık çıkar. Bunun üzerine, Fikri’nin önderliğinde Tozkoparanlar bir paintball alanında, sancağı ele geçirmeye çalışarak oklarla bir savaşı canlandıracaktır.
İskender, Tozkoparan yarışında olanlardan sonra Mete konusunda şüphelenir ve onu takip etmeye başlar. İskender’in şüpheci halleri diğerlerinin de dikkatini çekmiştir. Tüm bunlar yaşanırken, Gölge ise son taşın kimde olduğunu tespit eder.
İskenderin gördüğü rüyadan sonra Tozkoparanlar İstanbul’a doğru yola çıkarlar. Mete’nin görüsünden gidecekleri yerin Arkeoloji Müzesi olduğunu anlarlar. Ancak Gölge’nin oyununu hesaba katmamışlardır.
Elif, bedenine yerleştirilen özel bir çiple Gölge’nin ajanı haline gelmiştir. Arkadaşlarını zehirleyip onların zayıf düşmesine sebep olurken, Gölge, İskender için gelmektedir…
Gölge’nin manipüle ettiği onlarca insan, Elif’in önderliğinde birer robot gibi akademiye saldırır. İskender de Tozkoparanları bu savaşa hazırlamıştır. Çocuklar, Gölge’nin kuklası olan insanları alt etmeyi başarırlar. Fakat Cenk ve İskender’in asıl savaşları daha yeni başlamaktadır…