Die Filme beginnen dort, wo die NBC Serie aufhörte und führt den Pretender, Jarod, in die Reihen eines National Security Büros, und auf die Fährte eines verrückten Serien-Terroristen, mit dem Codenamen “Chamäleon” – wegen seiner genialen Fähigkeit, sich in jeden Menschen zu verwandeln, der er sein möchte. Da Jarod eine enge Verbindung zwischen dem Chamäleon und ihm, sowie dem letzten Opfer des Chamäleons (ein ehemaliger Agent des Security Büros) befürchtet, wird er in eine gigantische Menschenjagd verwickelt. Diese bringt Jarod – eigenartigerweise – an Orte seiner eigenen Vergangenheit und treibt ihn immer mehr in die Enge.
Jarod and Miss Parker learn more about their pasts, as Jarod attempts to stop another Pretender from seeking revenge against the powers that be at The Centre.
Mlle Parker a survécu à l'explosion survenue dans les tunnels du métro de Washington. Elle est convaincue que c'est sa mère, décédée depuis longtemps, qui l'a sauvée. Elle confie son sentiment à Sydney qui manifeste son incrédulité. La jeune femme se décide alors à parler de la mort de sa mère avec son père. Mais il a disparu... De son côté, Jarod est sur une nouvelle affaire liée au Centre. Il est persuadé que cette organisation travaillait à une opération -baptisée «T.T.» - d'infiltration de la NSA, l'Agence nationale de sécurité américaine. Or, quelques semaines plus tôt, un individu usurpant son identité a assassiné quatre des meilleurs agents de l'Agence... Tout comme Jarod, le tueur semble capable d'endosser n'importe quelle identité à l'insu de tous. Pour retrouver la trace du meurtrier, qui s'apprête à faire une cinquième victime, Jarod prend l'identité d'un agent de la NSA...
Jarod, Miss Parker ed Ethan sopravvivono all'esplosione del treno (vedi episodio "Senso interiore" (4.19-20)). Jarod ed Ethan si alleano contro il Centro, e dopo avere saputo che un agente della NSA (in cui Jarod riconosce un ex simulatore del Centro) è stato ucciso da qualcuno che stava tentando di uccidere un diplomatico Jarod si introduce all'interno della National Security Agency per catturare il suo killer, Alex, un terrorista chiamato "Camaleonte" che, come Jarod, ha l'abilità di diventare chiunque voglia essere. Alex in effetti è uno dei due simulatori scappati con Jarod dal Centro, ed è essenzialmente l'opposto malvagio di Jarod; l'esistenza di Alex era sempre stata nascosta a Miss Parker.
Nel frattempo, Sydney e Broots cercano di aiutare Miss Parker, che ha degli incubi spaventosi a causa del suo "senso interiore". Miss Parker scopre che suo padre è stato rapito da Alex; in seguito Mr. Parker viene liberato, ma Alex rivela a Miss Parker che l'uomo non è il suo vero padre. Jarod trova Alex e lo insegue, ma quando sta per catturarlo l'uomo si butta da un ponte, rivelando prima a Jarod che forse Mr. Parker non è il padre di Miss Parker, che lui non si rende ancora conto di quali siano le sue vere origini e che il Centro non vuole ricatturarlo solo perché è un simulatore... Alla fine, Mr. Raines, che è ancora vivo e il cui pollice è stato sottratto e trapiantato su Mr. Lyle, manda via e-mail a Jarod e a Miss Parker un'immagine che ritrae le loro due madri insieme...
Действие начинается со взрыва на станции метрополитена, которым завершилась последняя серия 4 сезона. На протяжении фильма Джарод столкнется с призраками из своего прошлого, а мисс Паркер лучше узнает сводного брата Итена и сделает невероятные открытия относительно собственного происхождения и прошлого своей матери. Становятся известны некоторые подробности бегства Джарода из Центра. Раскрываются старые тайны и появляются новые. Джарод перевоплощается в агента АНБ и пытается вычислить неуловимого убийцу, известного под кодовым именем — Хамелеон, ведущего с ним собственную игру, ставка в которой — человеческая жизнь...