After re-energizing the present-day Turtles, the Turtles of the past have only 3 hours to get back to their time, or they will all cease to exist. Meanwhile, during the 15 hours it took to re-energize the Turtles, the remainder of Dregg's invasion fleet has been completed and has been unleashed on the city and now the Turtles and Carter have to stop Dregg, Krang, and Shredder.
Carter, April y las tortugas del "pasado" están siendo atacadas por monstruos que se elevan a cincuenta pies sobre ellas. Los héroes finalmente escapan y llevan a las tortugas "presentes" debilitadas a la guarida. April se dirige para advertir a las autoridades del plan de ataque de Dregg. Dregg y su tripulación planean una invasión de Monstruos de Ataque para apoderarse de la Tierra y convertirla en su nueva base de operaciones, pero primero tiene que recuperar su chip transportador de Shredder ... Mientras tanto, Krang y Shredder se liberan de los escombros de la cueva. en la construcción y regresar a la planta de energía nuclear. De vuelta en la guarida de las Tortugas, las Tortugas debilitadas son revividas. Las tortugas del "pasado" quieren llegar a casa. Carter envía un mensaje a Landor y Merrick para llevar a las tortugas al pasado, pero no recibe respuesta.
