While Splinter's sensei, Mogo-san, is visiting New York, a criminal gang of ninja, known as the Black Heart Gang, are terrorizing the city with a crime spree, and Mogo-san's grandson, Yoku, is their leader. The Turtles & Splinter must stop Shredder & the Black Heart Gang from stealing secret maps of nuclear missile sites.
Mientras está sumido en la meditación, Splinter es contactado telepáticamente por su sensei, el Maestro Mogo-San, quien solicita que Splinter lo encuentre en el Muelle 17, donde llegará más tarde ese mismo día. Splinter está obedientemente de acuerdo. Mientras tanto, al otro lado de la ciudad, la famosa pandilla ninja Black Heart, dirigida por un joven llamado Yoku, ha estado robando los bancos de la ciudad y atrayendo la atención de Shredder y Krang, que quieren poner a la pandilla Black Heart a trabajar para ellos. En el muelle 17, llega Mogo-San y se sorprende al descubrir que Hamato Yoshi ahora es una rata. Splinter promete explicarlo todo, pero primero quiere saber qué lleva a su sensei a Estados Unidos. Mogo-San explica que ha llegado para pasar el cinturón blanco sagrado del clan Mogo a su nieto Yoku y que necesita la ayuda de Splinter para localizarlo. Este compañero de Yoku fue una vez un estudiante de Splinter y es el mismo Yoku que lidera la infame pandilla Black Heart.