Shredder uses a time machine to travel back to Ancient Japan in the year 1583. He plans to defeat Hamato Koji, the man who founded the Foot Clan, and Splinter's great ancestor, for if Hamato Koji is defeated, then Master Splinter would never have been born and the Turtles would forever remain ordinary turtles.
En el Museo de Bellas Artes de la ciudad, Shredder usa su invento del "Portal del tiempo" para viajar de regreso al antiguo Japón para poder "" destruir Splinter y las malditas tortugas de una vez por todas cambiando la historia "." Mientras tanto, Splinter ha experimentó una perturbación en la fuerza y sugirió a las tortugas que se apresuraran al Museo de Bellas Artes, donde siguen a Shredder hasta el año 1583, el año en que nació el Clan Foot. De vuelta en el antiguo Japón, Shredder asalta el palacio de Oroko Sancho y le informa que él es uno de sus descendientes, Oroko Saki, y que ha viajado desde el futuro para darle poder y riqueza más allá de sus sueños más salvajes. Pero después de que Shredder le cuenta sobre la ubicación de dos reliquias mágicas en el bosque que proporcionarían poder y riqueza a Oroko Sancho, el antepasado de Shredder decide que puede encontrarlo por sí mismo sin la ayuda de su descendiente.