As the Biomen tries to assist Professor Shibata on furthering his Conscious Circuit research, they unexpectedly discover Balzion's possible hiding place as Shirou discovers the surprising truth about the mysterious scientist.
Le professeur Shibata et Shûichi ont mis au point un nouveau système émotionnel qui devrait réussir à transformer les Mechas Clones.
En voulant le tester sur un Mecha Clone fraîchement capturé, le professeur provoque un séisme et réveille Balgion le Super Robot de Silver.
Mais quel est donc la véritable identité du professeur Shibata ?