전투기 조종사 케이 카츠라기 중위는 검증되지 않은 새로운 폭탄, 시공간 진동 폭탄을 보호하라는 임무를 받습니다. 임무를 수행하는 동안 폭탄이 터지고 재앙이 발생합니다.
20년 후, 테크노집시 그룹인 에만(Emaan)은 케이가 의식을 잃은 것을 발견하고 그를 데려갑니다. Kei는 곧 자신이 다른 차원에 있고 Emaan이 인간이 아니라는 사실을 알게 됩니다.
Im Jahr 2062 aktiviert der Kampfpilot Katsuragi Kei eine unkalibrierte Raumzeit-Oszillationsbombe und wird samt seines Kampfjägers Bronco II in eine andere Welt transportiert. Er wird von einem Glomar-Handelsschiff der Emaan eingesammelt und erfährt, dass Menschen wie er dort als "Singularität" bezeichnet werden.