Across the oceans, a terrorist group known as the USR is indiscriminately attacking other ships. To combat this menace, eleven countries join forces to form the Peace Keeping Navy, or PKN. Among them is Japan, whose representative—the Submarine 707—is a plodding underdog compared to the technological marvels of countries like America. In fact, the 707 is so slow in getting to the PKN's first meeting that it inadvertently sacrifices itself when the USR makes a surprise attack. After a new submarine is built, the 707's Captain Hayami comes out of retirement and prepares to defend the seas again. One by one, the technologically superior USR picks off the other nations' vessels, until finally Hayami must lead the 707 into battle with sheer guts and skill.
세계 각국에서는 바다의 평화를 지키기 위해 저마다의 정예 함선들을 모아 'PKN'이라는 다국적 해양 군사 조직을 만들게 되었다. 그러나 세계 정복을 꾀하는 정체불명의 조직 USR이 PKN의 결성식에 기습 공격을 해 온다. USR의 레드 제독이 이끄는 잠수함 UX 앞에서 이렇다 할 힘을 쓰지 못하고 무너지던 PKN이었지만, 일본의 구식 잠수함 707호의 하야미 함장의 결사적인 투쟁 덕분에 간신히 위기를 극복하게 된다.
1년 후 형체를 알아볼 수 없을 정도로 파손된 707호를 대신하여 새로이 건조된 707II호가 결전을 앞두고 출항한다. 이전에 연습생이었던 켄지, 고로, 센타 등의 소년들도 정식 승무원으로 항해에 참가한다. PKN 진영은 미국이 자랑하는 최신함 그레이트 가디언을 중심으로 작전을 세우지만, USR 함대의 격렬한 공격에 PKN 함대는 전멸하고 만다. 그곳에 도착한 새로운 707호. 레드는 707을 확인하자 숙적과의 재회에 기뻐하며 맹공을 퍼붓기 시작하는데...
L'océan est un havre de paix mais il peut aussi être un terrifiant champ de batailles. C'est pour lutter contre ce risque que s'est ainsi mise en place une organisation internationale: la PKN (l'acronyme de Peace Keeping Navy). Malheureusement, un maléfique sous-marin interrompt soudain la cérémonie. Il s'agit du UX, une imbattable machine dirigée par l'Amiral Red, lui-même à la tête d'un mouvement terroriste et d'opposition : la USR, qui signifie "Undersea Silent Revolution". L'UX attaque alors par surprise la flotte réunie par la PKN. La surprise est telle que les pacifistes n'ont pas le temps de réagir, tout semble perdu... Mais c'est sans compter sur le représentant de la flotte japonaise : le sous-marin 707 ! Arrivée en retard sur les lieux, la mythique machine de guerre parvient à sauver la flotte du PKN en faisant barrage soi-même aux missiles. Un sursis avant le carnage que promet l'Amiral Red...
In naher Zukunft.... Die Menschen haben mittlerweile auch die Ozeane kolonisiert und möchten in Frieden leben. Aber eine terroristische Gruppe, die sich USR nennt und mit ihrem U-Boot UX unter der Führung von Admiral Red, machen die Meere unsicher. Es wird eine Peacekeeping-Navy gegründet, in der verschiedene Großmächte der Marine-Einheiten zusammenfinden, aber auch sie können gegen Admiral Red nichts ausrichten.
Bei einem Treffen der Großmächte taucht Admiral Red auf und beginnt den Angriff. Als er gerade das Hauptschiff vernichten will, taucht Captain Youhei Hayami auf, der das U-Boot 707 befehligt und fährt genau in die Schussbahn des Torpedos. Die 707 wird zerstört, die Mannschaft konnte sich noch retten und Admiral Red zieht sauer ab. 6 Monate später bekommt Captain Hayami zu Hause Besuch und soll wieder das Kommando über U-Boot 707 übernehmen. Er nimmt den Job an und mit seiner Crew und der neuen 707 macht er sich auf die Suche nach Admiral Red...
