강마 전쟁 이후 수도 도쿄의 재건 사업이 진척되어 부흥의 징조가 보이는 시점에서 여전히 암약하고 있는 어둠의 세력으로부터 도쿄를 방어하기 위한 새로운 프로젝트가 시작된다. 제국 화격단을 위장하기 위해 제국 가극단이라는 이름으로 대형 극장을 짓고 공연을 펼치는 한편, 증기 전투 로봇 광무를 조종할 수 있는 영력을 지닌 소녀들로 구성된 ‘화조’라는 부대를 암암리에 결성하려는 것. 그리하여 부사령관 아야메는 일본과 세계에 흩어져 있는 영력을 지닌 소녀들을 발굴해 오는데...