Ein Raumschiff treibt steuerlos durchs All. An Bord tönen Alarmsirenen. Kaum dass sich ein Beiboot gelöst hat, vergeht das Schiff in einer Explosion. Dem Beiboot gelingt die Landung auf einem naheliegenden Planeten...
Japoness, 300 Jahre später. Otaru Mamiya geht gerade seinem Job als Fischverkäufer nach, als er von einer Automatik-Sänfte (so nennt man hier die Autos) über den Haufen gefahren wird. Wie sich herausstellt, wird diese von seinem "Erzfreund" Mitsurugi Hanagata gefahren - eigentlich heizt der Typ eher wie eine gesengte Sau - und es kommt zum Streit zwischen beiden. Mitsurugi ist der Meinung, Otaru hätte mal eine kräftige Abreibung verdient, und so kommt es also zur Schlägerei zwischen ihm (oder vielmehr seiner Gefolgschaft) und Otaru, welche dieser für sich entscheiden kann. Doch wie der Zufall - hier in Gestalt eines abbrechenden Pfostenteils - so will, bekommt auch Otaru sein Fett weg, und muß ein unfreiwilliges Bad im Fluß nehmen.
Als er ein gutes Stück flußabwärts wieder an Land gespült wird, entdeckt er ein halbverfallenes Gemäuer, welches die Aufschrift "Historisches Museum von Japoness" trägt. Er durchstreift daraufhin das Museum. Dort fällt ihm zum einen ein Porträt einer (echten) Frau auf, und zum anderen fällt er durch eine Falltür in einen geheimen Kellerraum. In diesem befindet sich eine geheimnisvolle Maschinerie, welche sich auch gleich aktiviert und nach einigen Augenblicken den Körper einer Marionette freigibt. Als diese erwacht, stellt sie sich ihm als Lime vor. Otaru nimmt Lime mit zu sich nach Hause. Endlich hat er seine eigene Marionette! Doch der Ärger ist schon vorprogrammiert, und tritt (natürlich) zuerst in Form des, noch immer wie bekloppt durch die Gegend heizenden, Mitsurugi auf. Währenddessen kommt es zu einem Vorfall mit einer vom Reich Gartland geschickten Spion-Marionette...
Three hundred years after six men crash-landed from space on an uninhabited planet named Terra II, six cities have developed (one for each of the original founders). Genetic engineering assured the survival of the race, as every man raises clones instead of children from natural propagation. Unable to genetically engineer women, however, has resulted in a planet of men and their android servants called marionettes, all of which take female form. But suddenly, out of happenstance, a local boy, Otaru, from the city of Japoness awakens a special marionette named Lime from a secret underground capsule. Lime has the ability to laugh and get angry and demonstrates amazing strength - attributes that make her unlike any other marionette. But more importantly Otaru and Lime become friends.
Todo empieza con un joven llamado Otaru Namiya, un habitante del planeta Terra II, (en el cual solo existen hombres que se multiplicaban con su ADN y las mujeres son robots llamados marionetas) el cual tras un conflicto con Mitsurugi Hanagata, acaba cayendo al río. La corriente lo lleva hasta un pequeño museo dedicado a los pioneros colonizadores. Ahí encuentra una cápsula en la que descansa una preciosa marioneta, al acercarse la cápsula se abre y ella dice llamarse Lima y resulta tener una personalidad infantil e inocente. En la ciudad de Japoness se produce un enfrentamiento entre dos marionetas sables del shogunato y una marioneta de combate de Gartland infiltrada. El combate produce serios daños a un edificio, y los escombros caen sobre Otaru, Lima detiene los escombros con facilidad pero a cambio se queda sin energía.