Der Film zur Serie Shoujo Kakumei Utena führt die Handlung weder fort, noch bettet er sich irgendwo in den 39 Episoden ein, sondern erzählt die Geschichte in einer parallelen Variante, die besonders durch die aufgemotzten Animationen und das aufpolierte Charadesign zu bestechen weiß. Man muss die Serie nicht kennen, um der Handlung folgen zu können und dennoch empfiehlt es sich, da die Symbolik des Films ziemlich hoch angesetzt ist und viele vertraute Serienelemente auftauchen, welche die Beweggründe der Charaktere deutlicher werden lassen. Auch haben Figuren ein Gastspiel, die für die wesentliche Handlung des Films komplett unerheblich sind, Fans der Serie aber ein vertrautes Gefühl vermitteln.
Tenjou Utena, ein Mädchen voller Ideale und mit hohen Zielen, kommt neu an die Ohtori Akademie, wo sie dank ihrer Kleidung zuerst für einen Jungen gehalten wird. Unverhofft trifft sie dort ihre alte Liebe Kiryuu Toga, der sagt, durch ein Rosensiegel ebenfalls dorthin geführt worden zu sein. Wortwörtlich durch die Blume gelangt auch Utena an so ein Siegel in Form eines Ringes und schon dreht sich die Spirale weiter, in der sie Himemiya Anthy trifft, die Rosenbraut. Wer sie besitzt, erlangt die Macht die Welt zu revolutionieren und um sie zu bekommen, muss man sich in einem Schwertduell messen. Ohne genau zu wissen warum, stürzt sich Utena in dieses gefährliche Spiel und bald wird klar, dass sie und Anthy ihre eigene Vergangenheit bewältigen müssen, um eine neue Zukunft für sich zu finden.
Der nicht ganz 90minütige Film macht es sich zur Aufgabe bekannte Figuren in neuem Licht zu präsentieren und konzentriert sich dabei vor allem auf Utena, Anthy und ihre Prinzen. Es gilt vergangene Traumata aufzubrechen und einer Welt zu entfliehen, die nach ihren eigenen Regeln lebt. Doch auch die anderen Duellanten und ihre Probleme werden in dieses Netz verworben, welches man wirklich besser verstehen kann, wenn man ein Vorwissen der Serie mitbringt, auch wenn hier
All eyes are on Utena Tenjou, a mysterious transfer student to Ohtori Academy. But Utena's eyes seem to be fixed on one familiar face that stands out among the rest—Touga Kiryuu, Utena's childhood friend. Touga knows of Utena's past and possesses knowledge of the Mark of the Rose, a set of unique rings worn by those who compete for the hand of the Rose Bride. The Rose Bride, Himemiya Anthy, belongs to whomever wins her in a duel, and the one that wins all the duels is said to be given the power to bring revolution to the world. Utena is drawn into the duels, but Touga and their complicated history together may end up unraveling everything. Nothing is as it seems in this retelling of the original anime series.
Appena arrivata al misterioso istituto scolastico Ohtori, in cui le pareti sono in continuo movimento, Utena Tenjo viene confusa da tutti per un ragazzo. La ragazza ben presto si troverà coinvolta in una serie di duelli per l'ottenimento della "sposa della rosa", Anthy Himemiya, e soprattutto del potere che essa possiede. Contemporaneamente Utena si rincontra con Touga Kiryuu, suo ex fidanzato. In realtà viene rivelato che Touga è morto diverso tempo prima.
Altre differenze sostanziali con le altre produzione è l'assenza di Nanami, salvo un breve cameo, sotto forma di mucca (il plot di un episodio della serie televisiva), ed il fatto che Akio è morto tempo prima dell'inizio del film. Nel film è inoltre molto più evidente la tensione erotica fra Utena ed Anthy, facendo intendere che la "sposa della rosa" aderisce a tutti i propri doveri di sposa. Nel surreale finale del film Utena si trasforma letteralmente in una automobile (così come avviene ad altri personaggi) per permettere a se stessa e ad Anthy di fuggire dall'istituto.
全寮制の名門学校・鳳学園に転校してきた天上ウテナは、「薔薇の花嫁」と呼ばれる謎の美少女・姫宮アンシーに出会い、生徒達との決闘ゲームに巻き込まれる。ウテナは徐々にアンシーと親しくなるが、その中でアンシーに隠された秘密を知り、彼女を連れて「外の世界」への脱出を試みようとする。
기숙명문학교 오토리학원에 전학온 텐죠 우테나는 '장미의 신부'라고 불리는 수수께끼의 미소녀 히메미야 안시와 만나게 되어 학생들과의 결투 게임에 말려든다. 우테나는 점점 안시와 가까워져가지만 도중 안시에게 감춰진 비밀을 알게되어 그녀를 데리고 '밖의 세계'로의 탈출을 시도하려 한다.
“不再等待王子,自己要變成王子”下了這種決心的歐帝娜,穿上了男裝,進入鳳學園。但是在學園內,擁有‘薔薇刻印'的決鬥者,正不斷進行著為了爭取‘薔薇新娘'決鬥。不知情的歐帝娜,在偶然的情況下得到了戒指,並捲入了決鬥中…