Ayato findet in bei einem Familienmitglied von Megumi vorerst eine Unterkunft. Nach anfänglichen Schwierigkeiten mit Megumis Großvater, erfährt Ayato mehr über die Familie.
Ayato is tested and found out to be normal, minus the symbol on his torso, Quon has one as well. While Ayato meets, Soyoko a co-worker and finds out he will be living with Haruko and her sister Megumi, and their uncle Rikudo. Meanwhile Itsuki finds out, that Quon is his sister. When Ayato is unpacking, he finds Buchi, which Quon packs for him. And after the dinner Rikudo gives Ayato a name plate.
Le commandant Kunugi, le major Souichi Yagumo et Makoto Isshiki font le compte rendu de l'affrontement contre le Dolem. Au même moment, Ayato et Quon passent des scans sous la direction du docteur Kisaragi ; on remarque que tous les deux possèdent une étrange marque au niveau de l'abdomen... Peu après, on emmène le jeune homme au centre de commandes de TERRA, mais il fait preuve d'une froideur extrême, tant envers Kunugi qu'Haruka, à qui il en veut pour ne pas lui avoir tout avoué avant. RahXephon se pétrifie petit à petit. Finalement, c'est Itsuki Kisaragi qui conduit Ayato vers l'endroit où il va être hébergé.
綾人のドーレム撃退によりラーゼフォンの連合への移送は中止、TERRAの本拠地・ニライカナイ島のネリヤ遺跡で運用されることになった。TERRAの一員として迎えられ、如月博士の案内で新しい家へと案内される綾人。そこは遙が妹の恵と同居している六道家であった。そこで過ごす時間の中で、綾人の心は開いていく。
Ayato se prueba y se descubre que es normal, menos el símbolo en su torso, Quon también tiene uno. Mientras Ayato conoce, Soyoko, una compañera de trabajo, y descubre que vivirá con Haruko y su hermana Megumi, y su tío Rikudo. Mientras tanto, Itsuki se entera de que Quon es su hermana. Cuando Ayato está desempacando, encuentra a Buchi, que Quon empaca para él. Y después de la cena, Rikudo le da a Ayato un plato con su nombre.