Connor hat ein Gerät entwickelt, mit dem er ermitteln kann, in welches Jahr eine Anomalie führt. Gleich beim ersten Einsatz scheint es nicht zu funktionieren: Es zeigt das Jahr 1867 an, obwohl die Anomalie eindeutig in die Urzeit zu führen scheint. Nach einem "Terrorvogel" kommt auch der totgeglaubte Danny durch die Anomalie in die Gegenwart. Als das Team kurz danach Ethan festnimmt, erkennt Danny in ihm seinen seit 18 Jahren verschollen Bruder Patrick wieder.
A pair of anomalies opens in a prison, one to the Pliocene allowing a terrorbird to attack, and Danny Quinn to return. He meets Ethan and realises he is his lost brother. Matt reveals he is from the future and trying to prevent an apocalypse involving the anomalies. Emily returns to the 19th C and both Danny and Ethan to the Pliocene. Connor discovers that the incidence of anomalies is increasing and potentially dangerous.
L'équipe du CRA est appelée à la prison d'Alcatraz pour une disparition d'individus. Elle y fait face à un problème jamais rencontré auparavant : la multiplication d'anomalies. Dans le même temps, Ethan a retrouvé la trace d'Emily et cherche toujours à se venger...
Il team sta indagando su un segnale anomalo che proviene da un appartamento e scoprono un Titanis che sta creando il caos. Mentre la squadra cerca di riprenderne il controllo, le cose si complicano quando Danny attraversa l'anomalia. Tuttavia gli abbracci e le spiegazioni vanno rimandate dopo aver mandato il Titanis indietro attraverso l'anomalia.
Un par de anomalías se abren en una prisión, una al plioceno permitiendo atacar a un pájaro del terror y regresar a Danny Quinn. Éste conoce a Ethan y se da cuenta de que es su hermano perdido. Matt revela que viene del futuro y está intentando prevenir un apocalipsis relacionado con las anomalías. Emily regresa al siglo 19 y tanto Danny como Ethan al plioceno. Connor descubre que la incidencia de anomalías se está incrementando y es potencialmente peligrosa.
Při prohlídce věznice zmizí turista, jehož průvodce na ukázku zamknul v jedné z cel. Když na místo dorazí výjezdovka z Archy, objeví podivnou anomálii, kterou nelze uzavřít. Takový je začátek dramatického sledu událostí, v jejichž průběhu budou jednotliví aktéři donuceni k úplnému, nebo alespoň částečnému odkrytí karet. O co jde Ethanovi a představuje opravdu takovou hrozbu, jak se zatím jeví? Kdo je ve skutečnosti Matt a jak je možné, že toho o anomáliích tolik ví? To jsou jen některé z otázek, vinoucích se celou čtvrtou řadou seriálu. Při hledání odpovědí pomůže hrdinům jeden starý známý, o němž si mysleli, že jej už nikdy nespatří. A zazní i jméno Helen Cutterové.