爆発を遂げた輸送船を調査し、「S.A.C」のエネルギー残留物を発見したアオイは襲来を確信する。さらに政府軍が「S.A.C」獲得に乗り出したことを知るに及んでアオイは宙域に警戒体制を敷く。一方、アンがネクスト病に感染、薬の調達に行こうとする者たちには、その得体の知れない厳戒体制があだとなり…。