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金融庁検査を乗り切るため、伊勢島ホテル社長の湯浅（駿河太郎）に、先代社長であり自身の父でもある会長の更迭と資産の売却をさせた半沢（堺雅人）。これで伊勢島ホテルが出した１２０億円にも及ぶ運用損失の穴埋めが実現し、不良融資先として分類されるのを回避出来たかに思えた。しかし金融庁検査の最中に、再建の柱ともなるＩＴシステムを構築中の外注先、「ナルセン」が破綻するとの情報が黒崎（片岡愛之助）からもたらされた。
ナルセンが破綻すると、これまで費やしてきた１１０億円以上もの投資が損失となってしまい、伊勢島ホテルは再び窮地に追い込まれる。事態を重く見た銀行幹部は、半沢を伊勢島ホテルの担当から外す方向で話を進めようとする。食い下がる上司の内藤（吉田鋼太郎）に対し、大和田常務（香川照之）は本番の金融庁検査の前に模擬検査を行うことを提案。大和田の息のかかった融資部の福山啓次郎（山田純大）を半沢の後任候補とし、模擬検査で一騎打ちをすることになった。
一方、出向先であるタミヤ電機の不正を追い続ける近藤（滝藤賢一）は、会社から他の会社へ不正に貸し付けられた３千万円の資金の行方を追ううちに、信じられない事実を目にすることになった─。
금융청 검사를 극복하기 위해, 이세섬 호텔 사장, 유아사(스루가 타로)에게 선대 사장이자 자신의 아버지이기도 한 회장의 경질과 자산 매각을 시킨 한자와(사카이 마사토). 이것으로 이세섬 호텔이 내놓은 120 억 엔에 달하는 운용 손실의 보충이 가능하고, 불량 대출 대상으로 분류되는 것을 방지할 수 있을 것으로 보였다. 그러나 금융청 검사 중에, 재건의 기둥이라 할 수 있는 IT 시스템을 구축 중인 외주처 "나루센"이 파산한다는 정보를 쿠로사키(카타오카 아이노스케)가 가져왔다.
나루센이 파산하면 지금까지 지출한 110억엔 이상의 투자가 손실로 처리되어버려, 이세섬 호텔은 다시 궁지에 몰리게 된다. 사태를 중요하게 본 은행 간부는 한자와를 이세섬 호텔의 담당에서 제외하는 방향으로 이야기를 진행하려고 한다. 물고 늘어지는 상사 나이토(요시다 강철 타로)에 대해, 오오와다 상무(카가와 테루유키)는 실제 금융청 검사 전에 모의 검사를 할 것을 제안했다. 오오와다의 목이 걸린 융자부의 후쿠야마 게이지로(야마다 준다이)를 한자와의 후임 후보로 하여, 모의검사에서 맞대결을 하게 되었다.
한편, 파견처인 타미야 전기의 부정을 계속 쫓는 콘도(타키토 켄이치)는, 회사에서 다른 회사에 무단으로 대출된 3 천만 엔의 자금의 행방을 쫓는 가운데 놀라운 사실을 알게 되는데...
大和田常務建議湯淺社長改變經營製度，可以獲得金融廳一年的延期。半澤直樹下跪請求大和田常務能多給伊勢島酒店一些時間，但大和田常務有意要將半澤直樹調離，不再負責這一事件，將要對半澤直樹進行金融廳模擬檢查，故意讓金融廳把銀行逼入絕境，好藉此逼迫行長下台。半澤為了不被換走，百般努力，四處奔走。意外發現，田宮電機的不正當行為與大和田常務有關。半澤在模擬檢查時抓住福山只認數據的弱點，擊潰了模擬檢查團，躲過一劫。
為了要通過金融廳檢查，半澤(堺雅人飾)要求伊勢島飯店的社長湯淺(駿河太郎飾)，撤換自己的會長父親，並且賣掉資產，以填補資金運用失敗的損失120億...
